Protein–RNA interactions for Protein: B2RXF0

TMEM229A, Transmembrane protein 229A, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229AB2RXF0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM229AB2RXF0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM229AB2RXF0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM229AB2RXF0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM229AB2RXF0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM229AB2RXF0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM229AB2RXF0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM229AB2RXF0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM229AB2RXF0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM229AB2RXF0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM229AB2RXF0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM229AB2RXF0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM229AB2RXF0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM229AB2RXF0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM229AB2RXF0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM229AB2RXF0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM229AB2RXF0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM229AB2RXF0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM229AB2RXF0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM229AB2RXF0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM229AB2RXF0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM229AB2RXF0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM229AB2RXF0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM229AB2RXF0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM229AB2RXF0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM229AB2RXF0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM229AB2RXF0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM229AB2RXF0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM229AB2RXF0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM229AB2RXF0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM229AB2RXF0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM229AB2RXF0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM229AB2RXF0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM229AB2RXF0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM229AB2RXF0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM229AB2RXF0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM229AB2RXF0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM229AB2RXF0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM229AB2RXF0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM229AB2RXF0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM229AB2RXF0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM229AB2RXF0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM229AB2RXF0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM229AB2RXF0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM229AB2RXF0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM229AB2RXF0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM229AB2RXF0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM229AB2RXF0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM229AB2RXF0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM229AB2RXF0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM229AB2RXF0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM229AB2RXF0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM229AB2RXF0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM229AB2RXF0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM229AB2RXF0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM229AB2RXF0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM229AB2RXF0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM229AB2RXF0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM229AB2RXF0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM229AB2RXF0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM229AB2RXF0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM229AB2RXF0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM229AB2RXF0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM229AB2RXF0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM229AB2RXF0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM229AB2RXF0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM229AB2RXF0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM229AB2RXF0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM229AB2RXF0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms