Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM1B2RUZ4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM1B2RUZ4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM1B2RUZ4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM1B2RUZ4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms