Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYSRT1A8MQ03 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYSRT1A8MQ03 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYSRT1A8MQ03 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms