Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF839A8K0R7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF839A8K0R7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF839A8K0R7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF839A8K0R7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF839A8K0R7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF839A8K0R7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF839A8K0R7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF839A8K0R7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF839A8K0R7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF839A8K0R7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF839A8K0R7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF839A8K0R7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF839A8K0R7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF839A8K0R7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF839A8K0R7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF839A8K0R7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF839A8K0R7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF839A8K0R7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF839A8K0R7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF839A8K0R7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF839A8K0R7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF839A8K0R7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF839A8K0R7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF839A8K0R7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF839A8K0R7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF839A8K0R7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF839A8K0R7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF839A8K0R7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF839A8K0R7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF839A8K0R7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF839A8K0R7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF839A8K0R7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms