Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD8B2A6NJW9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD8B2A6NJW9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD8B2A6NJW9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD8B2A6NJW9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD8B2A6NJW9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD8B2A6NJW9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD8B2A6NJW9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD8B2A6NJW9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD8B2A6NJW9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD8B2A6NJW9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD8B2A6NJW9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD8B2A6NJW9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CD8B2A6NJW9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD8B2A6NJW9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD8B2A6NJW9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD8B2A6NJW9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD8B2A6NJW9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD8B2A6NJW9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD8B2A6NJW9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD8B2A6NJW9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CD8B2A6NJW9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD8B2A6NJW9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD8B2A6NJW9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD8B2A6NJW9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD8B2A6NJW9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD8B2A6NJW9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD8B2A6NJW9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD8B2A6NJW9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CD8B2A6NJW9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD8B2A6NJW9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD8B2A6NJW9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD8B2A6NJW9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD8B2A6NJW9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD8B2A6NJW9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD8B2A6NJW9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD8B2A6NJW9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms