Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC01549A6NIU2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01549A6NIU2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01549A6NIU2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms