Protein–RNA interactions for Protein: A6NHY6

C9orf118, Putative uncharacterized protein C9orf118, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf118A6NHY6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf118A6NHY6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf118A6NHY6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf118A6NHY6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms