Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN8A6NHC0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN8A6NHC0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN8A6NHC0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN8A6NHC0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN8A6NHC0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN8A6NHC0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN8A6NHC0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN8A6NHC0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN8A6NHC0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN8A6NHC0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN8A6NHC0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN8A6NHC0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN8A6NHC0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN8A6NHC0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN8A6NHC0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN8A6NHC0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN8A6NHC0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN8A6NHC0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN8A6NHC0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN8A6NHC0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN8A6NHC0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN8A6NHC0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN8A6NHC0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN8A6NHC0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN8A6NHC0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN8A6NHC0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN8A6NHC0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPN8A6NHC0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN8A6NHC0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN8A6NHC0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN8A6NHC0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN8A6NHC0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN8A6NHC0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN8A6NHC0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN8A6NHC0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN8A6NHC0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN8A6NHC0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN8A6NHC0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN8A6NHC0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN8A6NHC0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN8A6NHC0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN8A6NHC0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN8A6NHC0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN8A6NHC0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN8A6NHC0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN8A6NHC0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN8A6NHC0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN8A6NHC0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN8A6NHC0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN8A6NHC0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN8A6NHC0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN8A6NHC0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN8A6NHC0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN8A6NHC0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN8A6NHC0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN8A6NHC0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN8A6NHC0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN8A6NHC0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN8A6NHC0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN8A6NHC0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN8A6NHC0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN8A6NHC0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN8A6NHC0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN8A6NHC0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN8A6NHC0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN8A6NHC0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN8A6NHC0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN8A6NHC0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN8A6NHC0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN8A6NHC0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN8A6NHC0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN8A6NHC0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN8A6NHC0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN8A6NHC0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN8A6NHC0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN8A6NHC0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN8A6NHC0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN8A6NHC0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN8A6NHC0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN8A6NHC0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN8A6NHC0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN8A6NHC0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN8A6NHC0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN8A6NHC0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN8A6NHC0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN8A6NHC0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN8A6NHC0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN8A6NHC0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN8A6NHC0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN8A6NHC0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN8A6NHC0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN8A6NHC0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN8A6NHC0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN8A6NHC0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN8A6NHC0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN8A6NHC0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN8A6NHC0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN8A6NHC0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN8A6NHC0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms