Protein–RNA interactions for Protein: A6NFN9

ANKUB1, Protein ANKUB1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKUB1A6NFN9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ANKUB1A6NFN9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ANKUB1A6NFN9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKUB1A6NFN9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKUB1A6NFN9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKUB1A6NFN9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKUB1A6NFN9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKUB1A6NFN9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKUB1A6NFN9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANKUB1A6NFN9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKUB1A6NFN9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKUB1A6NFN9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKUB1A6NFN9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKUB1A6NFN9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ANKUB1A6NFN9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKUB1A6NFN9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKUB1A6NFN9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKUB1A6NFN9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKUB1A6NFN9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ANKUB1A6NFN9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKUB1A6NFN9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKUB1A6NFN9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKUB1A6NFN9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKUB1A6NFN9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKUB1A6NFN9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKUB1A6NFN9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKUB1A6NFN9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKUB1A6NFN9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKUB1A6NFN9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKUB1A6NFN9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKUB1A6NFN9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKUB1A6NFN9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKUB1A6NFN9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKUB1A6NFN9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKUB1A6NFN9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKUB1A6NFN9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKUB1A6NFN9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKUB1A6NFN9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKUB1A6NFN9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKUB1A6NFN9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKUB1A6NFN9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKUB1A6NFN9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKUB1A6NFN9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKUB1A6NFN9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKUB1A6NFN9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKUB1A6NFN9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKUB1A6NFN9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKUB1A6NFN9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKUB1A6NFN9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKUB1A6NFN9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKUB1A6NFN9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ANKUB1A6NFN9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ANKUB1A6NFN9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKUB1A6NFN9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKUB1A6NFN9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKUB1A6NFN9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKUB1A6NFN9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKUB1A6NFN9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKUB1A6NFN9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKUB1A6NFN9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKUB1A6NFN9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKUB1A6NFN9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKUB1A6NFN9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms