Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOLGA6L9A6NEM1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOLGA6L9A6NEM1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOLGA6L9A6NEM1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOLGA6L9A6NEM1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOLGA6L9A6NEM1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOLGA6L9A6NEM1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GOLGA6L9A6NEM1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GOLGA6L9A6NEM1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GOLGA6L9A6NEM1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GOLGA6L9A6NEM1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GOLGA6L9A6NEM1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA6L9A6NEM1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA6L9A6NEM1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA6L9A6NEM1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA6L9A6NEM1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA6L9A6NEM1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA6L9A6NEM1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA6L9A6NEM1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA6L9A6NEM1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA6L9A6NEM1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6L9A6NEM1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6L9A6NEM1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6L9A6NEM1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6L9A6NEM1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6L9A6NEM1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6L9A6NEM1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6L9A6NEM1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6L9A6NEM1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA6L9A6NEM1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA6L9A6NEM1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA6L9A6NEM1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA6L9A6NEM1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA6L9A6NEM1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA6L9A6NEM1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA6L9A6NEM1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA6L9A6NEM1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GOLGA6L9A6NEM1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GOLGA6L9A6NEM1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GOLGA6L9A6NEM1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GOLGA6L9A6NEM1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GOLGA6L9A6NEM1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GOLGA6L9A6NEM1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GOLGA6L9A6NEM1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA6L9A6NEM1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6L9A6NEM1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6L9A6NEM1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6L9A6NEM1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6L9A6NEM1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GOLGA6L9A6NEM1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GOLGA6L9A6NEM1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L9A6NEM1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L9A6NEM1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L9A6NEM1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L9A6NEM1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L9A6NEM1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L9A6NEM1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GOLGA6L9A6NEM1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GOLGA6L9A6NEM1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GOLGA6L9A6NEM1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GOLGA6L9A6NEM1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GOLGA6L9A6NEM1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GOLGA6L9A6NEM1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GOLGA6L9A6NEM1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GOLGA6L9A6NEM1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA6L9A6NEM1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms