Protein–RNA interactions for Protein: A6NDI0

TRIM49B, Putative tripartite motif-containing protein 49B, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49BA6NDI0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM49BA6NDI0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM49BA6NDI0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM49BA6NDI0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM49BA6NDI0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM49BA6NDI0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM49BA6NDI0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM49BA6NDI0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM49BA6NDI0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM49BA6NDI0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM49BA6NDI0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM49BA6NDI0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM49BA6NDI0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM49BA6NDI0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM49BA6NDI0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM49BA6NDI0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM49BA6NDI0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM49BA6NDI0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM49BA6NDI0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM49BA6NDI0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM49BA6NDI0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM49BA6NDI0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM49BA6NDI0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM49BA6NDI0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM49BA6NDI0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM49BA6NDI0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM49BA6NDI0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM49BA6NDI0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM49BA6NDI0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM49BA6NDI0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM49BA6NDI0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM49BA6NDI0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM49BA6NDI0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM49BA6NDI0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM49BA6NDI0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM49BA6NDI0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM49BA6NDI0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM49BA6NDI0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM49BA6NDI0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM49BA6NDI0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM49BA6NDI0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM49BA6NDI0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM49BA6NDI0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM49BA6NDI0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM49BA6NDI0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM49BA6NDI0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM49BA6NDI0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM49BA6NDI0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM49BA6NDI0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM49BA6NDI0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM49BA6NDI0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
TRIM49BA6NDI0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM49BA6NDI0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM49BA6NDI0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM49BA6NDI0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM49BA6NDI0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM49BA6NDI0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM49BA6NDI0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM49BA6NDI0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM49BA6NDI0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM49BA6NDI0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM49BA6NDI0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM49BA6NDI0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM49BA6NDI0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM49BA6NDI0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM49BA6NDI0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM49BA6NDI0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRIM49BA6NDI0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms