Protein–RNA interactions for Protein: A5YKK6

CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1A5YKK6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT1A5YKK6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT1A5YKK6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT1A5YKK6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT1A5YKK6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT1A5YKK6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT1A5YKK6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT1A5YKK6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT1A5YKK6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT1A5YKK6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT1A5YKK6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT1A5YKK6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT1A5YKK6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT1A5YKK6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT1A5YKK6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT1A5YKK6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT1A5YKK6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT1A5YKK6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT1A5YKK6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT1A5YKK6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT1A5YKK6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT1A5YKK6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT1A5YKK6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT1A5YKK6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT1A5YKK6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT1A5YKK6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNOT1A5YKK6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNOT1A5YKK6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT1A5YKK6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT1A5YKK6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT1A5YKK6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT1A5YKK6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT1A5YKK6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT1A5YKK6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT1A5YKK6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT1A5YKK6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT1A5YKK6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT1A5YKK6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT1A5YKK6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT1A5YKK6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT1A5YKK6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNOT1A5YKK6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CNOT1A5YKK6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNOT1A5YKK6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNOT1A5YKK6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNOT1A5YKK6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNOT1A5YKK6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT1A5YKK6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT1A5YKK6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT1A5YKK6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT1A5YKK6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT1A5YKK6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT1A5YKK6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT1A5YKK6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT1A5YKK6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT1A5YKK6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNOT1A5YKK6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNOT1A5YKK6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT1A5YKK6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT1A5YKK6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT1A5YKK6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT1A5YKK6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT1A5YKK6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT1A5YKK6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms