Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
POTEFA5A3E0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
POTEFA5A3E0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
POTEFA5A3E0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
POTEFA5A3E0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
POTEFA5A3E0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POTEFA5A3E0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POTEFA5A3E0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POTEFA5A3E0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POTEFA5A3E0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POTEFA5A3E0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POTEFA5A3E0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POTEFA5A3E0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
POTEFA5A3E0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
POTEFA5A3E0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
POTEFA5A3E0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
POTEFA5A3E0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
POTEFA5A3E0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
POTEFA5A3E0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POTEFA5A3E0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POTEFA5A3E0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POTEFA5A3E0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POTEFA5A3E0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
POTEFA5A3E0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POTEFA5A3E0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POTEFA5A3E0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POTEFA5A3E0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
POTEFA5A3E0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
POTEFA5A3E0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POTEFA5A3E0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
POTEFA5A3E0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POTEFA5A3E0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POTEFA5A3E0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POTEFA5A3E0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
POTEFA5A3E0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
POTEFA5A3E0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
POTEFA5A3E0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
POTEFA5A3E0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POTEFA5A3E0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
POTEFA5A3E0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
POTEFA5A3E0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POTEFA5A3E0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POTEFA5A3E0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
POTEFA5A3E0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POTEFA5A3E0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POTEFA5A3E0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
POTEFA5A3E0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
POTEFA5A3E0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
POTEFA5A3E0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
POTEFA5A3E0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
POTEFA5A3E0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
POTEFA5A3E0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
POTEFA5A3E0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
POTEFA5A3E0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POTEFA5A3E0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POTEFA5A3E0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POTEFA5A3E0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POTEFA5A3E0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
POTEFA5A3E0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
POTEFA5A3E0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POTEFA5A3E0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
POTEFA5A3E0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
POTEFA5A3E0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
POTEFA5A3E0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
POTEFA5A3E0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
POTEFA5A3E0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
POTEFA5A3E0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
POTEFA5A3E0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
POTEFA5A3E0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
POTEFA5A3E0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
POTEFA5A3E0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
POTEFA5A3E0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
POTEFA5A3E0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POTEFA5A3E0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
POTEFA5A3E0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
POTEFA5A3E0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POTEFA5A3E0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
POTEFA5A3E0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
POTEFA5A3E0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
POTEFA5A3E0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
POTEFA5A3E0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POTEFA5A3E0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POTEFA5A3E0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POTEFA5A3E0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POTEFA5A3E0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POTEFA5A3E0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POTEFA5A3E0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POTEFA5A3E0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
POTEFA5A3E0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POTEFA5A3E0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
POTEFA5A3E0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POTEFA5A3E0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
POTEFA5A3E0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POTEFA5A3E0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POTEFA5A3E0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POTEFA5A3E0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POTEFA5A3E0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POTEFA5A3E0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POTEFA5A3E0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
POTEFA5A3E0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms