Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPED1A4D0V7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPED1A4D0V7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPED1A4D0V7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPED1A4D0V7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPED1A4D0V7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPED1A4D0V7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPED1A4D0V7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPED1A4D0V7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPED1A4D0V7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPED1A4D0V7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPED1A4D0V7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPED1A4D0V7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPED1A4D0V7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPED1A4D0V7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPED1A4D0V7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CPED1A4D0V7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CPED1A4D0V7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CPED1A4D0V7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPED1A4D0V7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPED1A4D0V7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPED1A4D0V7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPED1A4D0V7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPED1A4D0V7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPED1A4D0V7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPED1A4D0V7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPED1A4D0V7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPED1A4D0V7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPED1A4D0V7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPED1A4D0V7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPED1A4D0V7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPED1A4D0V7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CPED1A4D0V7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CPED1A4D0V7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPED1A4D0V7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPED1A4D0V7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPED1A4D0V7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPED1A4D0V7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPED1A4D0V7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPED1A4D0V7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CPED1A4D0V7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CPED1A4D0V7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPED1A4D0V7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPED1A4D0V7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPED1A4D0V7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPED1A4D0V7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPED1A4D0V7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPED1A4D0V7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPED1A4D0V7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPED1A4D0V7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPED1A4D0V7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPED1A4D0V7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPED1A4D0V7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPED1A4D0V7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPED1A4D0V7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CPED1A4D0V7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPED1A4D0V7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms