Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
PRAMEF22A3QJZ6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRAMEF22A3QJZ6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRAMEF22A3QJZ6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRAMEF22A3QJZ6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRAMEF22A3QJZ6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
PRAMEF22A3QJZ6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRAMEF22A3QJZ6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRAMEF22A3QJZ6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRAMEF22A3QJZ6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRAMEF22A3QJZ6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
PRAMEF22A3QJZ6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRAMEF22A3QJZ6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRAMEF22A3QJZ6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRAMEF22A3QJZ6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRAMEF22A3QJZ6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRAMEF22A3QJZ6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRAMEF22A3QJZ6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRAMEF22A3QJZ6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRAMEF22A3QJZ6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRAMEF22A3QJZ6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRAMEF22A3QJZ6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PRAMEF22A3QJZ6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRAMEF22A3QJZ6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRAMEF22A3QJZ6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRAMEF22A3QJZ6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRAMEF22A3QJZ6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRAMEF22A3QJZ6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PRAMEF22A3QJZ6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PRAMEF22A3QJZ6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
PRAMEF22A3QJZ6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PRAMEF22A3QJZ6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRAMEF22A3QJZ6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRAMEF22A3QJZ6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PRAMEF22A3QJZ6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PRAMEF22A3QJZ6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PRAMEF22A3QJZ6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PRAMEF22A3QJZ6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PRAMEF22A3QJZ6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PRAMEF22A3QJZ6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRAMEF22A3QJZ6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRAMEF22A3QJZ6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRAMEF22A3QJZ6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRAMEF22A3QJZ6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRAMEF22A3QJZ6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRAMEF22A3QJZ6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRAMEF22A3QJZ6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRAMEF22A3QJZ6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PRAMEF22A3QJZ6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRAMEF22A3QJZ6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRAMEF22A3QJZ6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRAMEF22A3QJZ6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
PRAMEF22A3QJZ6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
PRAMEF22A3QJZ6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRAMEF22A3QJZ6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRAMEF22A3QJZ6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
PRAMEF22A3QJZ6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRAMEF22A3QJZ6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRAMEF22A3QJZ6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRAMEF22A3QJZ6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRAMEF22A3QJZ6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRAMEF22A3QJZ6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRAMEF22A3QJZ6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRAMEF22A3QJZ6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRAMEF22A3QJZ6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRAMEF22A3QJZ6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRAMEF22A3QJZ6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PRAMEF22A3QJZ6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PRAMEF22A3QJZ6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PRAMEF22A3QJZ6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PRAMEF22A3QJZ6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
PRAMEF22A3QJZ6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
PRAMEF22A3QJZ6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRAMEF22A3QJZ6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRAMEF22A3QJZ6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRAMEF22A3QJZ6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PRAMEF22A3QJZ6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRAMEF22A3QJZ6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRAMEF22A3QJZ6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRAMEF22A3QJZ6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
PRAMEF22A3QJZ6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRAMEF22A3QJZ6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRAMEF22A3QJZ6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRAMEF22A3QJZ6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRAMEF22A3QJZ6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRAMEF22A3QJZ6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRAMEF22A3QJZ6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
PRAMEF22A3QJZ6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms