Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM89A2RUT3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM89A2RUT3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM89A2RUT3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM89A2RUT3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms