Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0T9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0T9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A087X0T9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A087X0T9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
A0A087X0T9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A087X0T9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A087X0T9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A087X0T9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A087X0T9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A087X0T9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A087X0T9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A087X0T9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A087X0T9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A087X0T9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A087X0T9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A087X0T9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A087X0T9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A087X0T9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
A0A087X0T9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
A0A087X0T9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A087X0T9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A087X0T9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A087X0T9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms