RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637475.1

CACNA1A-241, Transcript of calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A, humanhuman

Gene CACNA1A, Length 1,975 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1A-241ENST00000637475 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.48■■■■□ 3.91
CACNA1A-241ENST00000637475 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.26■■■■□ 3.24
CACNA1A-241ENST00000637475 ABCC9O60706 1549 aa35.09■■■■□ 3.21
CACNA1A-241ENST00000637475 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.47■■■□□ 2.95
CACNA1A-241ENST00000637475 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.46■■■□□ 2.95
CACNA1A-241ENST00000637475 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.34■■■□□ 2.93
CACNA1A-241ENST00000637475 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.29■■■□□ 2.92
CACNA1A-241ENST00000637475 NACADO15069 1562 aa33.28■■■□□ 2.92
CACNA1A-241ENST00000637475 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.98■■■□□ 2.87
CACNA1A-241ENST00000637475 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.86■■■□□ 2.85
CACNA1A-241ENST00000637475 HRCP23327 699 aa32.79■■■□□ 2.84
CACNA1A-241ENST00000637475 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.75■■■□□ 2.83
CACNA1A-241ENST00000637475 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.74■■■□□ 2.83
CACNA1A-241ENST00000637475 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.69■■■□□ 2.82
CACNA1A-241ENST00000637475 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.69■■■□□ 2.82
CACNA1A-241ENST00000637475 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.57■■■□□ 2.8
CACNA1A-241ENST00000637475 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.51■■■□□ 2.8
CACNA1A-241ENST00000637475 SCRIBQ14160 1630 aa32.24■■■□□ 2.75
CACNA1A-241ENST00000637475 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.04■■■□□ 2.72
CACNA1A-241ENST00000637475 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.69■■■□□ 2.66
CACNA1A-241ENST00000637475 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
CACNA1A-241ENST00000637475 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
CACNA1A-241ENST00000637475 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
CACNA1A-241ENST00000637475 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.55■■■□□ 2.64
CACNA1A-241ENST00000637475 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.47■■■□□ 2.63
CACNA1A-241ENST00000637475 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP31.34■■■□□ 2.61
CACNA1A-241ENST00000637475 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
CACNA1A-241ENST00000637475 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
CACNA1A-241ENST00000637475 TRIM41Q8WV44 630 aa30.87■■■□□ 2.53
CACNA1A-241ENST00000637475 SMARCA4P51532 1647 aa30.75■■■□□ 2.51
CACNA1A-241ENST00000637475 NCAPD3P42695 1498 aa30.73■■■□□ 2.51
CACNA1A-241ENST00000637475 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.7■■■□□ 2.51
CACNA1A-241ENST00000637475 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
CACNA1A-241ENST00000637475 SMARCA2P51531 1590 aa30.6■■■□□ 2.49
CACNA1A-241ENST00000637475 HMGXB3Q12766 1538 aa30.52■■■□□ 2.48
CACNA1A-241ENST00000637475 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.48■■■□□ 2.47
CACNA1A-241ENST00000637475 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.46
CACNA1A-241ENST00000637475 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
CACNA1A-241ENST00000637475 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.41■■■□□ 2.46
CACNA1A-241ENST00000637475 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
CACNA1A-241ENST00000637475 WIZO95785 1651 aa30.34■■■□□ 2.45
CACNA1A-241ENST00000637475 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.27■■■□□ 2.44
CACNA1A-241ENST00000637475 ERCC6Q03468 1493 aa30.25■■■□□ 2.43
CACNA1A-241ENST00000637475 NESP48681 1621 aa30.24■■■□□ 2.43
CACNA1A-241ENST00000637475 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
CACNA1A-241ENST00000637475 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
CACNA1A-241ENST00000637475 CUX2O14529 1486 aa30.05■■■□□ 2.4
CACNA1A-241ENST00000637475 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.99■■■□□ 2.39
CACNA1A-241ENST00000637475 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
CACNA1A-241ENST00000637475 EEA1Q15075 1411 aa29.94■■■□□ 2.38
CACNA1A-241ENST00000637475 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
CACNA1A-241ENST00000637475 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.9■■■□□ 2.38
CACNA1A-241ENST00000637475 CEP162Q5TB80 1403 aa29.86■■■□□ 2.37
CACNA1A-241ENST00000637475 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.84■■■□□ 2.37
CACNA1A-241ENST00000637475 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
CACNA1A-241ENST00000637475 NEUROD1Q13562 356 aa29.83■■■□□ 2.37
CACNA1A-241ENST00000637475 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.82■■■□□ 2.36
CACNA1A-241ENST00000637475 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
CACNA1A-241ENST00000637475 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.81■■■□□ 2.36
CACNA1A-241ENST00000637475 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.81■■■□□ 2.36
CACNA1A-241ENST00000637475 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
CACNA1A-241ENST00000637475 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.79■■■□□ 2.36
CACNA1A-241ENST00000637475 ABCC8Q09428 1581 aa29.77■■■□□ 2.36
CACNA1A-241ENST00000637475 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.75■■■□□ 2.35
CACNA1A-241ENST00000637475 MYT1Q01538 1121 aa29.7■■■□□ 2.34
CACNA1A-241ENST00000637475 GOLGA3Q08378 1498 aa29.6■■■□□ 2.33
CACNA1A-241ENST00000637475 SOGA1O94964 1423 aa29.6■■■□□ 2.33
CACNA1A-241ENST00000637475 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa29.56■■■□□ 2.32
CACNA1A-241ENST00000637475 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.55■■■□□ 2.32
CACNA1A-241ENST00000637475 CFTRP13569 1480 aa29.54■■■□□ 2.32
CACNA1A-241ENST00000637475 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
CACNA1A-241ENST00000637475 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.52■■■□□ 2.32
CACNA1A-241ENST00000637475 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.5■■■□□ 2.31
CACNA1A-241ENST00000637475 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.5■■■□□ 2.31
CACNA1A-241ENST00000637475 KIF21BO75037 1637 aa29.5■■■□□ 2.31
CACNA1A-241ENST00000637475 WDR62O43379 1518 aa29.47■■■□□ 2.31
CACNA1A-241ENST00000637475 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.39■■■□□ 2.3
CACNA1A-241ENST00000637475 PRDM2Q13029 1718 aa29.26■■■□□ 2.27
CACNA1A-241ENST00000637475 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
CACNA1A-241ENST00000637475 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.23■■■□□ 2.27
CACNA1A-241ENST00000637475 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
CACNA1A-241ENST00000637475 SYNJ1O43426 1573 aa29.19■■■□□ 2.26
CACNA1A-241ENST00000637475 CLIP1P30622 1438 aa29.17■■■□□ 2.26
CACNA1A-241ENST00000637475 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.11■■■□□ 2.25
CACNA1A-241ENST00000637475 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
CACNA1A-241ENST00000637475 MIER1Q8N108 512 aa29.02■■■□□ 2.24
CACNA1A-241ENST00000637475 TOPBP1Q92547 1522 aa28.98■■■□□ 2.23
CACNA1A-241ENST00000637475 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.94■■■□□ 2.22
CACNA1A-241ENST00000637475 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.92■■■□□ 2.22
CACNA1A-241ENST00000637475 TOP2BQ02880 1626 aa28.92■■■□□ 2.22
CACNA1A-241ENST00000637475 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.88■■■□□ 2.21
CACNA1A-241ENST00000637475 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.88■■■□□ 2.21
CACNA1A-241ENST00000637475 IFT140Q96RY7 1462 aa28.88■■■□□ 2.21
CACNA1A-241ENST00000637475 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
CACNA1A-241ENST00000637475 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
CACNA1A-241ENST00000637475 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
CACNA1A-241ENST00000637475 APLP2Q06481 763 aa28.8■■■□□ 2.2
CACNA1A-241ENST00000637475 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
CACNA1A-241ENST00000637475 PRXQ9BXM0 1461 aa28.77■■■□□ 2.2
CACNA1A-241ENST00000637475 OSCARQ8IYS5 282 aa28.75■■■□□ 2.19
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