RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630823.2

ARRDC3-AS1-203, ARRDC3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene ARRDC3-AS1, Length 737 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.52■■■□□ 2.16
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ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.56■■□□□ 1.36
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.18■■□□□ 1.3
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
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ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.63■■□□□ 1.21
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 SCRIBQ14160 1630 aa22.54■■□□□ 1.2
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.29■■□□□ 1.16
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.01■■□□□ 1.11
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 MROH2BQ7Z745 1585 aa22■■□□□ 1.11
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
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ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.67■■□□□ 1.06
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ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.57■■□□□ 1.04
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.54■■□□□ 1.04
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 SMARCA2P51531 1590 aa21.52■■□□□ 1.04
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.5■■□□□ 1.03
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.47■■□□□ 1.03
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
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ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.2■□□□□ 0.98
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.2■□□□□ 0.98
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 ABCC8Q09428 1581 aa21.17■□□□□ 0.98
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.07■□□□□ 0.96
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.04■□□□□ 0.96
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 HMGXB3Q12766 1538 aa20.99■□□□□ 0.95
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.97■□□□□ 0.95
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 SOGA1O94964 1423 aa20.96■□□□□ 0.95
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 NCAPD3P42695 1498 aa20.94■□□□□ 0.94
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 GOLGA3Q08378 1498 aa20.94■□□□□ 0.94
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 CEP162Q5TB80 1403 aa20.91■□□□□ 0.94
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 KIF21BO75037 1637 aa20.9■□□□□ 0.94
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 SYNJ1O43426 1573 aa20.89■□□□□ 0.94
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.87■□□□□ 0.93
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ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.54■□□□□ 0.88
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 CUX1P39880 1505 aa20.54■□□□□ 0.88
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.53■□□□□ 0.88
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 KIF27Q86VH2 1401 aa20.49■□□□□ 0.87
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ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.32■□□□□ 0.84
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
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ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 ARAP1Q96P48 1450 aa20.28■□□□□ 0.84
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ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20■□□□□ 0.79
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 EFCAB5A4FU69 1503 aa19.98■□□□□ 0.79
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 TIAM1Q13009 1591 aa19.95■□□□□ 0.78
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 WDR97A6NE52 1622 aa19.93■□□□□ 0.78
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.92■□□□□ 0.78
ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 CCNB3Q8WWL7 1395 aa19.92■□□□□ 0.78
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ARRDC3-AS1-203ENST00000630823 CFAP43Q8NDM7 1665 aa19.89■□□□□ 0.77
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