RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626667.1

PCAT5-201, prostate cancer associated transcript 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCAT5, Length 3,550 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT5-201ENST00000626667 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
PCAT5-201ENST00000626667 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.66■□□□□ 0.42
PCAT5-201ENST00000626667 NISCHQ9Y2I1 1504 aa16.44■□□□□ 0.22
PCAT5-201ENST00000626667 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PCAT5-201ENST00000626667 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PCAT5-201ENST00000626667 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa14.74□□□□□ -0.05
PCAT5-201ENST00000626667 PLPPR3Q6T4P5 718 aa14.32□□□□□ -0.12
PCAT5-201ENST00000626667 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa14.16□□□□□ -0.14
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PCAT5-201ENST00000626667 MYO15BQ96JP2 1530 aa13.92□□□□□ -0.18
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PCAT5-201ENST00000626667 UNC13AQ9UPW8 1703 aa13.35□□□□□ -0.27
PCAT5-201ENST00000626667 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
PCAT5-201ENST00000626667 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
PCAT5-201ENST00000626667 NACADO15069 1562 aa13.15□□□□□ -0.3
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PCAT5-201ENST00000626667 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa12.82□□□□□ -0.36
PCAT5-201ENST00000626667 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa12.79□□□□□ -0.36
PCAT5-201ENST00000626667 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
PCAT5-201ENST00000626667 SCRIBQ14160 1630 aa12.68□□□□□ -0.38
PCAT5-201ENST00000626667 SMARCA4P51532 1647 aa12.67□□□□□ -0.38
PCAT5-201ENST00000626667 PRDM2Q13029 1718 aa12.64□□□□□ -0.39
PCAT5-201ENST00000626667 WIZO95785 1651 aa12.61□□□□□ -0.39
PCAT5-201ENST00000626667 MROH2BQ7Z745 1585 aa12.61□□□□□ -0.39
PCAT5-201ENST00000626667 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa12.58□□□□□ -0.4
PCAT5-201ENST00000626667 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
PCAT5-201ENST00000626667 SMARCA2P51531 1590 aa12.54□□□□□ -0.4
PCAT5-201ENST00000626667 CECR2Q9BXF3 1484 aa12.46□□□□□ -0.41
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PCAT5-201ENST00000626667 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa12.39□□□□□ -0.43
PCAT5-201ENST00000626667 KCNA4P22459 653 aa12.34□□□□□ -0.43
PCAT5-201ENST00000626667 HMGXB3Q12766 1538 aa12.31□□□□□ -0.44
PCAT5-201ENST00000626667 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
PCAT5-201ENST00000626667 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa12.29□□□□□ -0.44
PCAT5-201ENST00000626667 DMRT2Q9Y5R5 561 aa12.24□□□□□ -0.45
PCAT5-201ENST00000626667 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
PCAT5-201ENST00000626667 WDR97A6NE52 1622 aa12.18□□□□□ -0.46
PCAT5-201ENST00000626667 CCDC88BA6NC98 1476 aa12.16□□□□□ -0.46
PCAT5-201ENST00000626667 KIF21BO75037 1637 aa12.16□□□□□ -0.46
PCAT5-201ENST00000626667 DNAJC5BQ9UF47 199 aa12.15□□□□□ -0.46
PCAT5-201ENST00000626667 TOP2BQ02880 1626 aa12.13□□□□□ -0.47
PCAT5-201ENST00000626667 NPM3O75607 178 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
PCAT5-201ENST00000626667 SYNJ1O43426 1573 aa12.09□□□□□ -0.47
PCAT5-201ENST00000626667 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
PCAT5-201ENST00000626667 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa12.07□□□□□ -0.48
PCAT5-201ENST00000626667 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
PCAT5-201ENST00000626667 NCAPD3P42695 1498 aa12.04□□□□□ -0.48
PCAT5-201ENST00000626667 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP12.03□□□□□ -0.48
PCAT5-201ENST00000626667 ERICH3Q5RHP9 1530 aa11.91□□□□□ -0.5
PCAT5-201ENST00000626667 ABCC8Q09428 1581 aa11.91□□□□□ -0.5
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PCAT5-201ENST00000626667 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
PCAT5-201ENST00000626667 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa11.83□□□□□ -0.52
PCAT5-201ENST00000626667 CUX1P39880 1505 aa11.82□□□□□ -0.52
PCAT5-201ENST00000626667 EEA1Q15075 1411 aa11.82□□□□□ -0.52
PCAT5-201ENST00000626667 PRXQ9BXM0 1461 aa11.78□□□□□ -0.52
PCAT5-201ENST00000626667 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa11.77□□□□□ -0.53
PCAT5-201ENST00000626667 CFAP43Q8NDM7 1665 aa11.74□□□□□ -0.53
PCAT5-201ENST00000626667 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
PCAT5-201ENST00000626667 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa11.72□□□□□ -0.53
PCAT5-201ENST00000626667 MAP3K1Q13233 1512 aa11.7□□□□□ -0.54
PCAT5-201ENST00000626667 CUX2O14529 1486 aa11.7□□□□□ -0.54
PCAT5-201ENST00000626667 POTEDQ86YR6 584 aa11.7□□□□□ -0.54
PCAT5-201ENST00000626667 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa11.7□□□□□ -0.54
PCAT5-201ENST00000626667 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa11.69□□□□□ -0.54
PCAT5-201ENST00000626667 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa11.68□□□□□ -0.54
PCAT5-201ENST00000626667 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
PCAT5-201ENST00000626667 SAMD9Q5K651 1589 aa11.66□□□□□ -0.54
PCAT5-201ENST00000626667 TNIKQ9UKE5 1360 aa11.63□□□□□ -0.55
PCAT5-201ENST00000626667 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa11.62□□□□□ -0.55
PCAT5-201ENST00000626667 CUL7Q14999 1698 aa11.61□□□□□ -0.55
PCAT5-201ENST00000626667 SOGA1O94964 1423 aa11.6□□□□□ -0.55
PCAT5-201ENST00000626667 DNMBPQ6XZF7 1577 aa11.6□□□□□ -0.55
PCAT5-201ENST00000626667 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PCAT5-201ENST00000626667 ARAP1Q96P48 1450 aa11.57□□□□□ -0.56
PCAT5-201ENST00000626667 ARHGEF11O15085 1522 aa11.55□□□□□ -0.56
PCAT5-201ENST00000626667 PBRM1Q86U86 1689 aa11.55□□□□□ -0.56
PCAT5-201ENST00000626667 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa11.53□□□□□ -0.56
PCAT5-201ENST00000626667 CEP164Q9UPV0 1460 aa11.51□□□□□ -0.57
PCAT5-201ENST00000626667 GOLGA3Q08378 1498 aa11.51□□□□□ -0.57
PCAT5-201ENST00000626667 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
PCAT5-201ENST00000626667 SLC4A2P04920 1241 aa11.46□□□□□ -0.58
PCAT5-201ENST00000626667 HRCP23327 699 aa11.46□□□□□ -0.58
PCAT5-201ENST00000626667 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP11.44□□□□□ -0.58
PCAT5-201ENST00000626667 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa11.44□□□□□ -0.58
PCAT5-201ENST00000626667 CEP162Q5TB80 1403 aa11.44□□□□□ -0.58
PCAT5-201ENST00000626667 EHMT2Q96KQ7 1210 aa11.43□□□□□ -0.58
PCAT5-201ENST00000626667 ZBTB22O15209 634 aa11.43□□□□□ -0.58
PCAT5-201ENST00000626667 CSRNP3Q8WYN3 585 aa11.41□□□□□ -0.58
PCAT5-201ENST00000626667 WDR62O43379 1518 aa11.41□□□□□ -0.58
PCAT5-201ENST00000626667 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa11.4□□□□□ -0.58
PCAT5-201ENST00000626667 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
PCAT5-201ENST00000626667 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
PCAT5-201ENST00000626667 FOXD4L1Q9NU39 408 aa11.38□□□□□ -0.59
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