RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609041.1

TAF4-208, Transcript of TATA-box binding protein associated factor 4, human

Gene TAF4, Length 2,487 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF4-208	ENST00000609041	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		40.78	■■■■■ 4.12
TAF4-208	ENST00000609041	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		34.74	■■■■□ 3.15
TAF4-208	ENST00000609041	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		34.6	■■■■□ 3.13
TAF4-208	ENST00000609041	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	34.48	■■■■□ 3.11
TAF4-208	ENST00000609041	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	33.87	■■■■□ 3.01
TAF4-208	ENST00000609041	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		33.77	■■■■□ 3
TAF4-208	ENST00000609041	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		33.49	■■■□□ 2.95
TAF4-208	ENST00000609041	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		32.9	■■■□□ 2.86
TAF4-208	ENST00000609041	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		32.73	■■■□□ 2.83
TAF4-208	ENST00000609041	SCRIB	Q14160	1630 aa		32.51	■■■□□ 2.79
TAF4-208	ENST00000609041	ABCC9	O60706	1549 aa		32.5	■■■□□ 2.79
TAF4-208	ENST00000609041	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
TAF4-208	ENST00000609041	NACAD	O15069	1562 aa		32.16	■■■□□ 2.74
TAF4-208	ENST00000609041	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		31.89	■■■□□ 2.7
TAF4-208	ENST00000609041	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		31.84	■■■□□ 2.69
TAF4-208	ENST00000609041	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		31.8	■■■□□ 2.68
TAF4-208	ENST00000609041	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		31.71	■■■□□ 2.67
TAF4-208	ENST00000609041	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		31.69	■■■□□ 2.66
TAF4-208	ENST00000609041	HRC	P23327	699 aa		31.64	■■■□□ 2.65
TAF4-208	ENST00000609041	TRIM41	Q8WV44	630 aa		31.58	■■■□□ 2.65
TAF4-208	ENST00000609041	WIZ	O95785	1651 aa		31.5	■■■□□ 2.63
TAF4-208	ENST00000609041	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	31.33	■■■□□ 2.61
TAF4-208	ENST00000609041	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	31.29	■■■□□ 2.6
TAF4-208	ENST00000609041	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
TAF4-208	ENST00000609041	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		31.15	■■■□□ 2.58
TAF4-208	ENST00000609041	SMARCA4	P51532	1647 aa		31.08	■■■□□ 2.57
TAF4-208	ENST00000609041	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.05	■■■□□ 2.56
TAF4-208	ENST00000609041	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	31.03	■■■□□ 2.56
TAF4-208	ENST00000609041	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		30.99	■■■□□ 2.55
TAF4-208	ENST00000609041	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	30.97	■■■□□ 2.55
TAF4-208	ENST00000609041	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		30.89	■■■□□ 2.53
TAF4-208	ENST00000609041	SMARCA2	P51531	1590 aa		30.85	■■■□□ 2.53
TAF4-208	ENST00000609041	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	30.81	■■■□□ 2.52
TAF4-208	ENST00000609041	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		30.8	■■■□□ 2.52
TAF4-208	ENST00000609041	ABCC8	Q09428	1581 aa		30.74	■■■□□ 2.51
TAF4-208	ENST00000609041	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		30.52	■■■□□ 2.48
TAF4-208	ENST00000609041	SOGA1	O94964	1423 aa		30.44	■■■□□ 2.46
TAF4-208	ENST00000609041	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	30.42	■■■□□ 2.46
TAF4-208	ENST00000609041	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		30.33	■■■□□ 2.45
TAF4-208	ENST00000609041	EEA1	Q15075	1411 aa		30.29	■■■□□ 2.44
TAF4-208	ENST00000609041	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		30.28	■■■□□ 2.44
TAF4-208	ENST00000609041	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	30.26	■■■□□ 2.44
TAF4-208	ENST00000609041	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		30.25	■■■□□ 2.43
TAF4-208	ENST00000609041	CEP162	Q5TB80	1403 aa		30.24	■■■□□ 2.43
TAF4-208	ENST00000609041	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	30.23	■■■□□ 2.43
TAF4-208	ENST00000609041	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		30.21	■■■□□ 2.43
TAF4-208	ENST00000609041	SYNJ1	O43426	1573 aa		30.12	■■■□□ 2.41
TAF4-208	ENST00000609041	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	30.1	■■■□□ 2.41
TAF4-208	ENST00000609041	GOLGA3	Q08378	1498 aa		30.06	■■■□□ 2.4
TAF4-208	ENST00000609041	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	29.97	■■■□□ 2.39
TAF4-208	ENST00000609041	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	29.93	■■■□□ 2.38
TAF4-208	ENST00000609041	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.91	■■■□□ 2.38
TAF4-208	ENST00000609041	KIF21B	O75037	1637 aa		29.87	■■■□□ 2.37
TAF4-208	ENST00000609041	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	29.85	■■■□□ 2.37
TAF4-208	ENST00000609041	TOP2B	Q02880	1626 aa		29.77	■■■□□ 2.36
TAF4-208	ENST00000609041	NCAPD3	P42695	1498 aa		29.76	■■■□□ 2.36
TAF4-208	ENST00000609041	HMGXB3	Q12766	1538 aa		29.75	■■■□□ 2.35
TAF4-208	ENST00000609041	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		29.71	■■■□□ 2.35
TAF4-208	ENST00000609041	CLIP1	P30622	1438 aa		29.71	■■■□□ 2.35
TAF4-208	ENST00000609041	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		29.66	■■■□□ 2.34
TAF4-208	ENST00000609041	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		29.57	■■■□□ 2.32
TAF4-208	ENST00000609041	CUX1	P39880	1505 aa		29.51	■■■□□ 2.31
TAF4-208	ENST00000609041	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	29.5	■■■□□ 2.31
TAF4-208	ENST00000609041	CFTR	P13569	1480 aa		29.49	■■■□□ 2.31
TAF4-208	ENST00000609041	PRX	Q9BXM0	1461 aa		29.45	■■■□□ 2.31
TAF4-208	ENST00000609041	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		29.43	■■■□□ 2.3
TAF4-208	ENST00000609041	APLP2	Q06481	763 aa		29.39	■■■□□ 2.3
TAF4-208	ENST00000609041	KIF27	Q86VH2	1401 aa		29.34	■■■□□ 2.29
TAF4-208	ENST00000609041	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	29.33	■■■□□ 2.29
TAF4-208	ENST00000609041	ARAP1	Q96P48	1450 aa		29.26	■■■□□ 2.27
TAF4-208	ENST00000609041	PRDM2	Q13029	1718 aa		29.21	■■■□□ 2.27
TAF4-208	ENST00000609041	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		29.18	■■■□□ 2.26
TAF4-208	ENST00000609041	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
TAF4-208	ENST00000609041	CUX2	O14529	1486 aa		29.08	■■■□□ 2.25
TAF4-208	ENST00000609041	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
TAF4-208	ENST00000609041	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TAF4-208	ENST00000609041	IGF1R	P08069	1367 aa		29.04	■■■□□ 2.24
TAF4-208	ENST00000609041	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TAF4-208	ENST00000609041	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
TAF4-208	ENST00000609041	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.24
TAF4-208	ENST00000609041	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		29.01	■■■□□ 2.23
TAF4-208	ENST00000609041	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TAF4-208	ENST00000609041	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TAF4-208	ENST00000609041	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
TAF4-208	ENST00000609041	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
TAF4-208	ENST00000609041	NEUROD1	Q13562	356 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TAF4-208	ENST00000609041	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
TAF4-208	ENST00000609041	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		28.75	■■■□□ 2.19
TAF4-208	ENST00000609041	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TAF4-208	ENST00000609041	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TAF4-208	ENST00000609041	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.72	■■■□□ 2.19
TAF4-208	ENST00000609041	NES	P48681	1621 aa		28.72	■■■□□ 2.19
TAF4-208	ENST00000609041	TOPBP1	Q92547	1522 aa		28.7	■■■□□ 2.18
TAF4-208	ENST00000609041	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
TAF4-208	ENST00000609041	TIAM1	Q13009	1591 aa		28.68	■■■□□ 2.18
TAF4-208	ENST00000609041	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
TAF4-208	ENST00000609041	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		28.68	■■■□□ 2.18
TAF4-208	ENST00000609041	MAP3K1	Q13233	1512 aa		28.66	■■■□□ 2.18
TAF4-208	ENST00000609041	ITGAE	P38570	1179 aa		28.61	■■■□□ 2.17
TAF4-208	ENST00000609041	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		28.59	■■■□□ 2.17

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