RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562648.2

FBXL16-205, Transcript of F-box and leucine rich repeat protein 16, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FBXL16, Length 2,531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL16-205ENST00000562648 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.98■■■■■ 7.51
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FBXL16-205ENST00000562648 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.8■■■■■ 5.88
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FBXL16-205ENST00000562648 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.11■■■■■ 5.61
FBXL16-205ENST00000562648 SCRIBQ14160 1630 aa49.52■■■■■ 5.52
FBXL16-205ENST00000562648 ABCC9O60706 1549 aa49.49■■■■■ 5.51
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FBXL16-205ENST00000562648 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa48.86■■■■■ 5.41
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FBXL16-205ENST00000562648 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.55■■■■■ 5.36
FBXL16-205ENST00000562648 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.47■■■■■ 5.35
FBXL16-205ENST00000562648 HRCP23327 699 aa48.4■■■■■ 5.34
FBXL16-205ENST00000562648 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.26■■■■■ 5.32
FBXL16-205ENST00000562648 TRIM41Q8WV44 630 aa48.18■■■■■ 5.3
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FBXL16-205ENST00000562648 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.68■■■■■ 5.22
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FBXL16-205ENST00000562648 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.58■■■■■ 5.21
FBXL16-205ENST00000562648 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP47.58■■■■■ 5.21
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FBXL16-205ENST00000562648 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.14■■■■■ 5.14
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FBXL16-205ENST00000562648 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.35■■■■■ 5.01
FBXL16-205ENST00000562648 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP46.33■■■■■ 5.01
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FBXL16-205ENST00000562648 CSRNP3Q8WYN3 585 aa46.08■■■■■ 4.97
FBXL16-205ENST00000562648 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.04■■■■■ 4.96
FBXL16-205ENST00000562648 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP46.01■■■■■ 4.96
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FBXL16-205ENST00000562648 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.97■■■■■ 4.95
FBXL16-205ENST00000562648 EEA1Q15075 1411 aa45.95■■■■■ 4.95
FBXL16-205ENST00000562648 UBTFP17480 764 aaKnown RBP45.93■■■■■ 4.94
FBXL16-205ENST00000562648 SYNJ1O43426 1573 aa45.88■■■■■ 4.94
FBXL16-205ENST00000562648 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP45.86■■■■■ 4.93
FBXL16-205ENST00000562648 GOLGA3Q08378 1498 aa45.73■■■■■ 4.91
FBXL16-205ENST00000562648 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP45.63■■■■■ 4.9
FBXL16-205ENST00000562648 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.48■■■■■ 4.87
FBXL16-205ENST00000562648 KIF21BO75037 1637 aa45.42■■■■■ 4.86
FBXL16-205ENST00000562648 NCAPD3P42695 1498 aa45.35■■■■■ 4.85
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FBXL16-205ENST00000562648 HMGXB3Q12766 1538 aa45.26■■■■■ 4.84
FBXL16-205ENST00000562648 TOP2BQ02880 1626 aa45.25■■■■■ 4.83
FBXL16-205ENST00000562648 CLIP1P30622 1438 aa45.25■■■■■ 4.83
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FBXL16-205ENST00000562648 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.08■■■■■ 4.81
FBXL16-205ENST00000562648 VPS8Q8N3P4 1428 aa45.01■■■■■ 4.8
FBXL16-205ENST00000562648 CUX1P39880 1505 aa44.91■■■■■ 4.78
FBXL16-205ENST00000562648 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP44.89■■■■■ 4.78
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FBXL16-205ENST00000562648 PRXQ9BXM0 1461 aa44.78■■■■■ 4.76
FBXL16-205ENST00000562648 APLP2Q06481 763 aa44.77■■■■■ 4.76
FBXL16-205ENST00000562648 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.69■■■■■ 4.74
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FBXL16-205ENST00000562648 KIF27Q86VH2 1401 aa44.59■■■■■ 4.73
FBXL16-205ENST00000562648 ARAP1Q96P48 1450 aa44.57■■■■■ 4.73
FBXL16-205ENST00000562648 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP44.57■■■■■ 4.73
FBXL16-205ENST00000562648 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.54■■■■■ 4.72
FBXL16-205ENST00000562648 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.45■■■■■ 4.71
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FBXL16-205ENST00000562648 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP44.4■■■■■ 4.7
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FBXL16-205ENST00000562648 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.03■■■■■ 4.64
FBXL16-205ENST00000562648 NESP48681 1621 aa44■■■■■ 4.63
FBXL16-205ENST00000562648 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.98■■■■■ 4.63
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FBXL16-205ENST00000562648 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.8■■■■■ 4.6
FBXL16-205ENST00000562648 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.79■■■■■ 4.6
FBXL16-205ENST00000562648 ITGAEP38570 1179 aa43.79■■■■■ 4.6
FBXL16-205ENST00000562648 CCNB3Q8WWL7 1395 aa43.79■■■■■ 4.6
FBXL16-205ENST00000562648 MIER1Q8N108 512 aa43.77■■■■■ 4.6
FBXL16-205ENST00000562648 TOPBP1Q92547 1522 aa43.7■■■■■ 4.59
FBXL16-205ENST00000562648 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.7■■■■■ 4.59
FBXL16-205ENST00000562648 P3H3Q8IVL6 736 aa43.7■■■■■ 4.59
FBXL16-205ENST00000562648 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP43.68■■■■■ 4.58
FBXL16-205ENST00000562648 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa43.68■■■■■ 4.58
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