RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561204.5

MEIS3-211, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEIS3, Length 2,195 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-211ENST00000561204 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.56■■■■□ 3.44
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MEIS3-211ENST00000561204 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.94■■■□□ 2.54
MEIS3-211ENST00000561204 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
MEIS3-211ENST00000561204 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
MEIS3-211ENST00000561204 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.13■■■□□ 2.41
MEIS3-211ENST00000561204 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.06■■■□□ 2.4
MEIS3-211ENST00000561204 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.48■■■□□ 2.31
MEIS3-211ENST00000561204 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.37■■■□□ 2.29
MEIS3-211ENST00000561204 ABCC9O60706 1549 aa29.16■■■□□ 2.26
MEIS3-211ENST00000561204 SCRIBQ14160 1630 aa29.12■■■□□ 2.25
MEIS3-211ENST00000561204 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
MEIS3-211ENST00000561204 NACADO15069 1562 aa28.82■■■□□ 2.2
MEIS3-211ENST00000561204 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.56■■■□□ 2.16
MEIS3-211ENST00000561204 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.55■■■□□ 2.16
MEIS3-211ENST00000561204 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.48■■■□□ 2.15
MEIS3-211ENST00000561204 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.4■■■□□ 2.14
MEIS3-211ENST00000561204 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.4■■■□□ 2.14
MEIS3-211ENST00000561204 HRCP23327 699 aa28.39■■■□□ 2.14
MEIS3-211ENST00000561204 TRIM41Q8WV44 630 aa28.26■■■□□ 2.11
MEIS3-211ENST00000561204 WIZO95785 1651 aa28.24■■■□□ 2.11
MEIS3-211ENST00000561204 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
MEIS3-211ENST00000561204 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.97■■■□□ 2.07
MEIS3-211ENST00000561204 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
MEIS3-211ENST00000561204 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
MEIS3-211ENST00000561204 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
MEIS3-211ENST00000561204 SMARCA4P51532 1647 aa27.87■■■□□ 2.05
MEIS3-211ENST00000561204 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
MEIS3-211ENST00000561204 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
MEIS3-211ENST00000561204 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.68■■■□□ 2.02
MEIS3-211ENST00000561204 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.67■■■□□ 2.02
MEIS3-211ENST00000561204 SMARCA2P51531 1590 aa27.67■■■□□ 2.02
MEIS3-211ENST00000561204 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.61■■■□□ 2.01
MEIS3-211ENST00000561204 ABCC8Q09428 1581 aa27.55■■■□□ 2
MEIS3-211ENST00000561204 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.51■■□□□ 1.99
MEIS3-211ENST00000561204 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.39■■□□□ 1.97
MEIS3-211ENST00000561204 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
MEIS3-211ENST00000561204 SOGA1O94964 1423 aa27.26■■□□□ 1.96
MEIS3-211ENST00000561204 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.16■■□□□ 1.94
MEIS3-211ENST00000561204 EEA1Q15075 1411 aa27.15■■□□□ 1.94
MEIS3-211ENST00000561204 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.14■■□□□ 1.93
MEIS3-211ENST00000561204 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.11■■□□□ 1.93
MEIS3-211ENST00000561204 CEP162Q5TB80 1403 aa27.1■■□□□ 1.93
MEIS3-211ENST00000561204 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.09■■□□□ 1.93
MEIS3-211ENST00000561204 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.08■■□□□ 1.93
MEIS3-211ENST00000561204 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
MEIS3-211ENST00000561204 SYNJ1O43426 1573 aa27.01■■□□□ 1.91
MEIS3-211ENST00000561204 GOLGA3Q08378 1498 aa26.94■■□□□ 1.9
MEIS3-211ENST00000561204 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
MEIS3-211ENST00000561204 KIF21BO75037 1637 aa26.82■■□□□ 1.88
MEIS3-211ENST00000561204 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.81■■□□□ 1.88
MEIS3-211ENST00000561204 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
MEIS3-211ENST00000561204 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
MEIS3-211ENST00000561204 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
MEIS3-211ENST00000561204 TOP2BQ02880 1626 aa26.7■■□□□ 1.87
MEIS3-211ENST00000561204 HMGXB3Q12766 1538 aa26.68■■□□□ 1.86
MEIS3-211ENST00000561204 NCAPD3P42695 1498 aa26.67■■□□□ 1.86
MEIS3-211ENST00000561204 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.63■■□□□ 1.85
MEIS3-211ENST00000561204 CLIP1P30622 1438 aa26.61■■□□□ 1.85
MEIS3-211ENST00000561204 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.61■■□□□ 1.85
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MEIS3-211ENST00000561204 CUX1P39880 1505 aa26.46■■□□□ 1.83
MEIS3-211ENST00000561204 CFTRP13569 1480 aa26.42■■□□□ 1.82
MEIS3-211ENST00000561204 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.41■■□□□ 1.82
MEIS3-211ENST00000561204 PRXQ9BXM0 1461 aa26.41■■□□□ 1.82
MEIS3-211ENST00000561204 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
MEIS3-211ENST00000561204 APLP2Q06481 763 aa26.28■■□□□ 1.8
MEIS3-211ENST00000561204 KIF27Q86VH2 1401 aa26.28■■□□□ 1.8
MEIS3-211ENST00000561204 PRDM2Q13029 1718 aa26.26■■□□□ 1.79
MEIS3-211ENST00000561204 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
MEIS3-211ENST00000561204 ARAP1Q96P48 1450 aa26.23■■□□□ 1.79
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MEIS3-211ENST00000561204 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.11■■□□□ 1.77
MEIS3-211ENST00000561204 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
MEIS3-211ENST00000561204 CUX2O14529 1486 aa26.03■■□□□ 1.76
MEIS3-211ENST00000561204 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
MEIS3-211ENST00000561204 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.02■■□□□ 1.76
MEIS3-211ENST00000561204 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.02■■□□□ 1.76
MEIS3-211ENST00000561204 IGF1RP08069 1367 aa26■■□□□ 1.75
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
MEIS3-211ENST00000561204 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.97■■□□□ 1.75
MEIS3-211ENST00000561204 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
MEIS3-211ENST00000561204 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.88■■□□□ 1.73
MEIS3-211ENST00000561204 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
MEIS3-211ENST00000561204 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.86■■□□□ 1.73
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MEIS3-211ENST00000561204 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.76■■□□□ 1.71
MEIS3-211ENST00000561204 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.75■■□□□ 1.71
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MEIS3-211ENST00000561204 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
MEIS3-211ENST00000561204 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.71■■□□□ 1.71
MEIS3-211ENST00000561204 TOPBP1Q92547 1522 aa25.7■■□□□ 1.7
MEIS3-211ENST00000561204 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.7■■□□□ 1.7
MEIS3-211ENST00000561204 NESP48681 1621 aa25.69■■□□□ 1.7
MEIS3-211ENST00000561204 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
MEIS3-211ENST00000561204 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.62■■□□□ 1.69
MEIS3-211ENST00000561204 MIER1Q8N108 512 aa25.61■■□□□ 1.69
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