RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554725.1

OTX2-AS1-204, Transcript of OTX2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene OTX2-AS1, Length 587 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2-AS1-204ENST00000554725 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
OTX2-AS1-204ENST00000554725 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.98■■□□□ 1.27
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OTX2-AS1-204ENST00000554725 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
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OTX2-AS1-204ENST00000554725 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.26■□□□□ 0.35
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OTX2-AS1-204ENST00000554725 NACADO15069 1562 aa17.17■□□□□ 0.34
OTX2-AS1-204ENST00000554725 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.04■□□□□ 0.32
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OTX2-AS1-204ENST00000554725 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.58■□□□□ 0.24
OTX2-AS1-204ENST00000554725 BICRAQ9NZM4 1560 aa16.51■□□□□ 0.23
OTX2-AS1-204ENST00000554725 KCNA4P22459 653 aa16.51■□□□□ 0.23
OTX2-AS1-204ENST00000554725 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.38■□□□□ 0.21
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OTX2-AS1-204ENST00000554725 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
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OTX2-AS1-204ENST00000554725 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.21■□□□□ 0.19
OTX2-AS1-204ENST00000554725 SMARCA4P51532 1647 aa16.19■□□□□ 0.18
OTX2-AS1-204ENST00000554725 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa16.19■□□□□ 0.18
OTX2-AS1-204ENST00000554725 WIZO95785 1651 aa16.08■□□□□ 0.17
OTX2-AS1-204ENST00000554725 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa16.05■□□□□ 0.16
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OTX2-AS1-204ENST00000554725 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
OTX2-AS1-204ENST00000554725 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.01■□□□□ 0.15
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OTX2-AS1-204ENST00000554725 SMARCA2P51531 1590 aa15.95■□□□□ 0.14
OTX2-AS1-204ENST00000554725 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
OTX2-AS1-204ENST00000554725 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa15.93■□□□□ 0.14
OTX2-AS1-204ENST00000554725 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
OTX2-AS1-204ENST00000554725 NCAPD3P42695 1498 aa15.83■□□□□ 0.12
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OTX2-AS1-204ENST00000554725 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.81■□□□□ 0.12
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OTX2-AS1-204ENST00000554725 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.33■□□□□ 0.05
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OTX2-AS1-204ENST00000554725 SYNJ1O43426 1573 aa15.24■□□□□ 0.03
OTX2-AS1-204ENST00000554725 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.23■□□□□ 0.03
OTX2-AS1-204ENST00000554725 ZBTB22O15209 634 aa15.22■□□□□ 0.03
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OTX2-AS1-204ENST00000554725 SLC4A2P04920 1241 aa15.04■□□□□ -0
OTX2-AS1-204ENST00000554725 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.02■□□□□ -0
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OTX2-AS1-204ENST00000554725 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
OTX2-AS1-204ENST00000554725 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.01□□□□□ -0.01
OTX2-AS1-204ENST00000554725 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa14.99□□□□□ -0.01
OTX2-AS1-204ENST00000554725 ERCC6Q03468 1493 aa14.97□□□□□ -0.01
OTX2-AS1-204ENST00000554725 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
OTX2-AS1-204ENST00000554725 WDR62O43379 1518 aa14.94□□□□□ -0.02
OTX2-AS1-204ENST00000554725 KIF27Q86VH2 1401 aa14.92□□□□□ -0.02
OTX2-AS1-204ENST00000554725 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa14.92□□□□□ -0.02
OTX2-AS1-204ENST00000554725 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
OTX2-AS1-204ENST00000554725 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.91□□□□□ -0.02
OTX2-AS1-204ENST00000554725 CUX2O14529 1486 aa14.89□□□□□ -0.03
OTX2-AS1-204ENST00000554725 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.89□□□□□ -0.03
OTX2-AS1-204ENST00000554725 WDR97A6NE52 1622 aa14.89□□□□□ -0.03
OTX2-AS1-204ENST00000554725 KIF21BO75037 1637 aa14.87□□□□□ -0.03
OTX2-AS1-204ENST00000554725 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
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OTX2-AS1-204ENST00000554725 IFT140Q96RY7 1462 aa14.81□□□□□ -0.04
OTX2-AS1-204ENST00000554725 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.81□□□□□ -0.04
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