RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548122.2

PTPRB-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 4,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-206ENST00000548122 NISCHQ9Y2I1 1504 aa11.97□□□□□ -0.49
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PTPRB-206ENST00000548122 ABCC8Q09428 1581 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRB-206ENST00000548122 CUX2O14529 1486 aa8.87□□□□□ -0.99
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PTPRB-206ENST00000548122 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
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PTPRB-206ENST00000548122 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
PTPRB-206ENST00000548122 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP8.81□□□□□ -1
PTPRB-206ENST00000548122 TRHP20396 242 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
PTPRB-206ENST00000548122 IFT140Q96RY7 1462 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRB-206ENST00000548122 TOPBP1Q92547 1522 aa8.78□□□□□ -1
PTPRB-206ENST00000548122 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP8.77□□□□□ -1.01
PTPRB-206ENST00000548122 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-206ENST00000548122 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-206ENST00000548122 FGD5Q6ZNL6 1462 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-206ENST00000548122 CYB5RLQ6IPT4 315 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-206ENST00000548122 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-206ENST00000548122 KIF27Q86VH2 1401 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-206ENST00000548122 DNMBPQ6XZF7 1577 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-206ENST00000548122 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRB-206ENST00000548122 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-206ENST00000548122 APLP2Q06481 763 aa8.7□□□□□ -1.02
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PTPRB-206ENST00000548122 GAPVD1Q14C86 1478 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-206ENST00000548122 WDR62O43379 1518 aa8.69□□□□□ -1.02
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PTPRB-206ENST00000548122 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-206ENST00000548122 GRIN2BQ13224 1484 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-206ENST00000548122 ARID3CA6NKF2 412 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-206ENST00000548122 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRB-206ENST00000548122 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRB-206ENST00000548122 MYT1LQ9UL68 1186 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRB-206ENST00000548122 CUX1P39880 1505 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRB-206ENST00000548122 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-206ENST00000548122 JPH4Q96JJ6 628 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-206ENST00000548122 ERICH6Q7L0X2 663 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRB-206ENST00000548122 FHAD1B1AJZ9 1412 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRB-206ENST00000548122 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRB-206ENST00000548122 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-206ENST00000548122 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-206ENST00000548122 SYNJ1O43426 1573 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-206ENST00000548122 SYNJ2O15056 1496 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-206ENST00000548122 KCNH8Q96L42 1107 aa8.56□□□□□ -1.04
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