RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519815.5

TRPS1-210, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-210ENST00000519815 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
TRPS1-210ENST00000519815 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.68■■□□□ 1.54
TRPS1-210ENST00000519815 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.92■■□□□ 1.42
TRPS1-210ENST00000519815 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
TRPS1-210ENST00000519815 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
TRPS1-210ENST00000519815 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.89■□□□□ 0.94
TRPS1-210ENST00000519815 FOXD1Q16676 465 aa20.26■□□□□ 0.83
TRPS1-210ENST00000519815 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
TRPS1-210ENST00000519815 ABCC9O60706 1549 aa19.96■□□□□ 0.79
TRPS1-210ENST00000519815 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.89■□□□□ 0.77
TRPS1-210ENST00000519815 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.87■□□□□ 0.77
TRPS1-210ENST00000519815 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa19.8■□□□□ 0.76
TRPS1-210ENST00000519815 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.65■□□□□ 0.74
TRPS1-210ENST00000519815 NACADO15069 1562 aa19.57■□□□□ 0.72
TRPS1-210ENST00000519815 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa19.43■□□□□ 0.7
TRPS1-210ENST00000519815 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa19.36■□□□□ 0.69
TRPS1-210ENST00000519815 PPP6R1Q9UPN7 881 aa19.21■□□□□ 0.67
TRPS1-210ENST00000519815 SCRIBQ14160 1630 aa19.18■□□□□ 0.66
TRPS1-210ENST00000519815 ADRA2BP18089 450 aa19.17■□□□□ 0.66
TRPS1-210ENST00000519815 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
TRPS1-210ENST00000519815 UNC13AQ9UPW8 1703 aa18.89■□□□□ 0.61
TRPS1-210ENST00000519815 MSH5O43196 834 aa18.84■□□□□ 0.61
TRPS1-210ENST00000519815 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.82■□□□□ 0.6
TRPS1-210ENST00000519815 BICRAQ9NZM4 1560 aa18.8■□□□□ 0.6
TRPS1-210ENST00000519815 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
TRPS1-210ENST00000519815 CECR2Q9BXF3 1484 aa18.58■□□□□ 0.56
TRPS1-210ENST00000519815 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
TRPS1-210ENST00000519815 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
TRPS1-210ENST00000519815 MROH2BQ7Z745 1585 aa18.44■□□□□ 0.54
TRPS1-210ENST00000519815 SMARCA4P51532 1647 aa18.38■□□□□ 0.53
TRPS1-210ENST00000519815 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
TRPS1-210ENST00000519815 WIZO95785 1651 aa18.25■□□□□ 0.51
TRPS1-210ENST00000519815 PEG3Q9GZU2 1588 aa18.2■□□□□ 0.5
TRPS1-210ENST00000519815 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa18.18■□□□□ 0.5
TRPS1-210ENST00000519815 SMARCA2P51531 1590 aa18.17■□□□□ 0.5
TRPS1-210ENST00000519815 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
TRPS1-210ENST00000519815 NCAPD3P42695 1498 aa18.08■□□□□ 0.49
TRPS1-210ENST00000519815 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
TRPS1-210ENST00000519815 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa18.03■□□□□ 0.48
TRPS1-210ENST00000519815 HMGXB3Q12766 1538 aa18■□□□□ 0.47
TRPS1-210ENST00000519815 CCDC88BA6NC98 1476 aa17.94■□□□□ 0.46
TRPS1-210ENST00000519815 KCNA4P22459 653 aa17.79■□□□□ 0.44
TRPS1-210ENST00000519815 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.79■□□□□ 0.44
TRPS1-210ENST00000519815 POTEDQ86YR6 584 aa17.76■□□□□ 0.43
TRPS1-210ENST00000519815 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.62■□□□□ 0.41
TRPS1-210ENST00000519815 CFTRP13569 1480 aa17.61■□□□□ 0.41
TRPS1-210ENST00000519815 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
TRPS1-210ENST00000519815 TRIM41Q8WV44 630 aa17.52■□□□□ 0.4
TRPS1-210ENST00000519815 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.52■□□□□ 0.4
TRPS1-210ENST00000519815 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
TRPS1-210ENST00000519815 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa17.48■□□□□ 0.39
TRPS1-210ENST00000519815 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.45■□□□□ 0.38
TRPS1-210ENST00000519815 NESP48681 1621 aa17.44■□□□□ 0.38
TRPS1-210ENST00000519815 ABCC8Q09428 1581 aa17.44■□□□□ 0.38
TRPS1-210ENST00000519815 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP17.42■□□□□ 0.38
TRPS1-210ENST00000519815 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.39■□□□□ 0.37
TRPS1-210ENST00000519815 PDS5BQ9NTI5 1447 aa17.38■□□□□ 0.37
TRPS1-210ENST00000519815 PRDM2Q13029 1718 aa17.38■□□□□ 0.37
TRPS1-210ENST00000519815 DMRT2Q9Y5R5 561 aa17.34■□□□□ 0.37
TRPS1-210ENST00000519815 CEP164Q9UPV0 1460 aa17.29■□□□□ 0.36
TRPS1-210ENST00000519815 SYNJ1O43426 1573 aa17.28■□□□□ 0.36
TRPS1-210ENST00000519815 TOP2BQ02880 1626 aa17.26■□□□□ 0.35
TRPS1-210ENST00000519815 CUX1P39880 1505 aa17.26■□□□□ 0.35
TRPS1-210ENST00000519815 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa17.22■□□□□ 0.35
TRPS1-210ENST00000519815 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa17.17■□□□□ 0.34
TRPS1-210ENST00000519815 DNMBPQ6XZF7 1577 aa17.17■□□□□ 0.34
TRPS1-210ENST00000519815 TOPBP1Q92547 1522 aa17.16■□□□□ 0.34
TRPS1-210ENST00000519815 ERCC6Q03468 1493 aa17.16■□□□□ 0.34
TRPS1-210ENST00000519815 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
TRPS1-210ENST00000519815 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
TRPS1-210ENST00000519815 MRC2Q9UBG0 1479 aa17.13■□□□□ 0.33
TRPS1-210ENST00000519815 SOGA1O94964 1423 aa17.13■□□□□ 0.33
TRPS1-210ENST00000519815 EEA1Q15075 1411 aa17.12■□□□□ 0.33
TRPS1-210ENST00000519815 FGD5Q6ZNL6 1462 aa17.12■□□□□ 0.33
TRPS1-210ENST00000519815 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa17.07■□□□□ 0.32
TRPS1-210ENST00000519815 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.06■□□□□ 0.32
TRPS1-210ENST00000519815 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
TRPS1-210ENST00000519815 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa17.04■□□□□ 0.32
TRPS1-210ENST00000519815 WDR62O43379 1518 aa17.02■□□□□ 0.32
TRPS1-210ENST00000519815 KIF27Q86VH2 1401 aa17.02■□□□□ 0.31
TRPS1-210ENST00000519815 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
TRPS1-210ENST00000519815 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa17■□□□□ 0.31
TRPS1-210ENST00000519815 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa17■□□□□ 0.31
TRPS1-210ENST00000519815 CUX2O14529 1486 aa16.99■□□□□ 0.31
TRPS1-210ENST00000519815 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.97■□□□□ 0.31
TRPS1-210ENST00000519815 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
TRPS1-210ENST00000519815 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
TRPS1-210ENST00000519815 IFT140Q96RY7 1462 aa16.91■□□□□ 0.3
TRPS1-210ENST00000519815 IGF1RP08069 1367 aa16.89■□□□□ 0.3
TRPS1-210ENST00000519815 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
TRPS1-210ENST00000519815 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
TRPS1-210ENST00000519815 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
TRPS1-210ENST00000519815 WDR97A6NE52 1622 aa16.85■□□□□ 0.29
TRPS1-210ENST00000519815 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPS1-210ENST00000519815 PRXQ9BXM0 1461 aa16.83■□□□□ 0.28
TRPS1-210ENST00000519815 KIF21BO75037 1637 aa16.82■□□□□ 0.28
TRPS1-210ENST00000519815 GOLGA3Q08378 1498 aa16.82■□□□□ 0.28
TRPS1-210ENST00000519815 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
TRPS1-210ENST00000519815 UBTFP17480 764 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
TRPS1-210ENST00000519815 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa16.8■□□□□ 0.28
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