RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426725.1

RNASEH1-AS1-201, RNASEH1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene RNASEH1-AS1, Length 836 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.82■■■■□ 3.97
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.79■■■■□ 3.32
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP34.95■■■■□ 3.19
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 FOXD1Q16676 465 aa32.52■■■□□ 2.8
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.28■■■□□ 2.76
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 PLPPR3Q6T4P5 718 aa32.17■■■□□ 2.74
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 ABCC9O60706 1549 aa32.03■■■□□ 2.72
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 PPP6R1Q9UPN7 881 aa31.02■■■□□ 2.56
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 ADRA2BP18089 450 aa30.97■■■□□ 2.55
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.63■■■□□ 2.49
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 NACADO15069 1562 aa30.43■■■□□ 2.46
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 MSH5O43196 834 aa30.09■■■□□ 2.41
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.06■■■□□ 2.4
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30■■■□□ 2.39
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.96■■■□□ 2.39
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.94■■■□□ 2.38
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RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.71■■■□□ 2.35
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.66■■■□□ 2.34
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.44■■■□□ 2.3
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 SCRIBQ14160 1630 aa29.24■■■□□ 2.27
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.03■■■□□ 2.24
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.9■■■□□ 2.22
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa28.32■■■□□ 2.12
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 POTEDQ86YR6 584 aa28.07■■■□□ 2.08
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 NCAPD3P42695 1498 aa28.03■■■□□ 2.08
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 SMARCA4P51532 1647 aa27.96■■■□□ 2.07
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.93■■■□□ 2.06
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 SMARCA2P51531 1590 aa27.92■■■□□ 2.06
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 HMGXB3Q12766 1538 aa27.91■■■□□ 2.06
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.85■■■□□ 2.05
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.74■■■□□ 2.03
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 CUX2O14529 1486 aa27.74■■■□□ 2.03
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 ERCC6Q03468 1493 aa27.7■■■□□ 2.02
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa27.59■■■□□ 2.01
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.58■■■□□ 2.01
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.53■■■□□ 2
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 NESP48681 1621 aa27.51■■□□□ 1.99
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.48■■□□□ 1.99
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.29■■□□□ 1.96
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 KCNA4P22459 653 aa27.25■■□□□ 1.95
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.24■■□□□ 1.95
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 WIZO95785 1651 aa27.24■■□□□ 1.95
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.14■■□□□ 1.94
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 NPM3O75607 178 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.01■■□□□ 1.91
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 WDR62O43379 1518 aa27■■□□□ 1.91
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.91■■□□□ 1.9
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 CFTRP13569 1480 aa26.87■■□□□ 1.89
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.85■■□□□ 1.89
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 PRDM2Q13029 1718 aa26.79■■□□□ 1.88
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 DCAF8L1A6NGE4 600 aa26.69■■□□□ 1.86
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.54■■□□□ 1.84
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 IFT140Q96RY7 1462 aa26.37■■□□□ 1.81
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 ABCC8Q09428 1581 aa26.36■■□□□ 1.81
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 TOPBP1Q92547 1522 aa26.35■■□□□ 1.81
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 OSCARQ8IYS5 282 aa26.32■■□□□ 1.8
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.31■■□□□ 1.8
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 TRIM41Q8WV44 630 aa26.28■■□□□ 1.8
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.1■■□□□ 1.77
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.1■■□□□ 1.77
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.1■■□□□ 1.77
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 CHD1O14646 1710 aa26.05■■□□□ 1.76
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 WDR97A6NE52 1622 aa26.01■■□□□ 1.75
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 ARHGEF11O15085 1522 aa25.99■■□□□ 1.75
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.75
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.91■■□□□ 1.74
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 SOGA1O94964 1423 aa25.91■■□□□ 1.74
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.91■■□□□ 1.74
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 CUX1P39880 1505 aa25.88■■□□□ 1.73
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.87■■□□□ 1.73
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.79■■□□□ 1.72
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 RNF39Q9H2S5 420 aa25.76■■□□□ 1.71
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 FBLN2P98095 1184 aa25.75■■□□□ 1.71
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 GRIN2BQ13224 1484 aa25.74■■□□□ 1.71
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 PBRM1Q86U86 1689 aa25.74■■□□□ 1.71
RNASEH1-AS1-201ENST00000426725 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.73■■□□□ 1.71
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