RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297163.3

SMAD5-AS1-201, SMAD5 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD5-AS1, Length 1,816 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SCRIBQ14160 1630 aa14.93□□□□□ -0.02
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa14.76□□□□□ -0.05
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SMARCA2P51531 1590 aa14.18□□□□□ -0.14
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PEG3Q9GZU2 1588 aa14.17□□□□□ -0.14
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ERCC6Q03468 1493 aa13.74□□□□□ -0.21
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FANCD2Q9BXW9 1451 aa13.63□□□□□ -0.23
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PRDM2Q13029 1718 aa13.55□□□□□ -0.24
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PLSCR2Q9NRY7 297 aa13.52□□□□□ -0.25
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 DNMBPQ6XZF7 1577 aa13.39□□□□□ -0.27
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 APLP2Q06481 763 aa13.39□□□□□ -0.27
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CUX1P39880 1505 aa13.35□□□□□ -0.27
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 HAX1O00165 279 aa13.33□□□□□ -0.28
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 IFT140Q96RY7 1462 aa13.31□□□□□ -0.28
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TRHP20396 242 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP13.28□□□□□ -0.28
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FGD5Q6ZNL6 1462 aa13.28□□□□□ -0.28
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SOGA1O94964 1423 aa13.26□□□□□ -0.29
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa13.26□□□□□ -0.29
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SYNJ1O43426 1573 aa13.23□□□□□ -0.29
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TOP2BQ02880 1626 aa13.23□□□□□ -0.29
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 LHX8Q68G74 356 aa13.21□□□□□ -0.29
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa13.21□□□□□ -0.29
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