RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000132397.1

Gm20517-202, Transcript of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm20517, Length 4,807 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rhox8Q6VSS7 320 aa30.42■■■□□ 2.46
Gm20517-202ENSMUST00000132397 NischQ80TM9 1593 aa28.27■■■□□ 2.12
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa27.49■■□□□ 1.99
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa27.43■■□□□ 1.98
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cngb1E1AZ71 1325 aa26.84■■□□□ 1.89
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Trim41Q5NCC3 630 aa26.64■■□□□ 1.85
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Abcc9P70170 1546 aa26.56■■□□□ 1.84
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gab3Q8BSM5 595 aa26.46■■□□□ 1.83
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Abcc8B2RUS7 1588 aa26.11■■□□□ 1.77
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zeb1Q64318 1117 aa26.05■■□□□ 1.76
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Npm2Q80W85 207 aa26.05■■□□□ 1.76
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Wdr66E9Q743 1299 aa26.04■■□□□ 1.76
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa25.97■■□□□ 1.75
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Myt1lP97500 1187 aa25.94■■□□□ 1.74
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ccdc180J3QNE4 1664 aa25.74■■□□□ 1.71
Gm20517-202ENSMUST00000132397 HrcG5E8J6 738 aa25.65■■□□□ 1.7
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ube2uB1AUC4 352 aa25.62■■□□□ 1.69
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Il27Q8K3I6 234 aa25.5■■□□□ 1.67
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rtl1Q7M732 1744 aa25.46■■□□□ 1.67
Gm20517-202ENSMUST00000132397 NefmP08553 848 aa25.42■■□□□ 1.66
Gm20517-202ENSMUST00000132397 UbtfP25976 765 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pcgf6Q99NA9 353 aa24.97■■□□□ 1.59
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa24.86■■□□□ 1.57
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa24.82■■□□□ 1.56
Gm20517-202ENSMUST00000132397 CenpbP27790 599 aa24.78■■□□□ 1.56
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Stra8P70278 393 aa24.68■■□□□ 1.54
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc24a1Q91WD8 1130 aa24.58■■□□□ 1.53
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
Gm20517-202ENSMUST00000132397 NacadQ5SWP3 1504 aa24.57■■□□□ 1.52
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Dcaf1Q80TR8 1506 aa24.5■■□□□ 1.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Chic1Q8CBW7 227 aa24.46■■□□□ 1.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mier1Q5UAK0 511 aa24.46■■□□□ 1.51
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa24.42■■□□□ 1.5
Gm20517-202ENSMUST00000132397 NclP09405 707 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
Gm20517-202ENSMUST00000132397 TonslQ6NZL6 1363 aa24.32■■□□□ 1.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa24.29■■□□□ 1.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lmod2Q3UHZ5 550 aa24.27■■□□□ 1.48
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Baz1aO88379 1555 aa24.26■■□□□ 1.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Kdm5dQ62240 1548 aa24.22■■□□□ 1.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Neurod1Q60867 357 aa24.21■■□□□ 1.47
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cep164Q5DU05 1446 aa24.16■■□□□ 1.46
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tnnt3Q9QZ47 272 aa24.14■■□□□ 1.46
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ubl4bQ9CQ84 188 aa24.13■■□□□ 1.45
Gm20517-202ENSMUST00000132397 NrdcQ8BHG1 1161 aa24.1■■□□□ 1.45
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
Gm20517-202ENSMUST00000132397 ClspnQ80YR7 1315 aa23.92■■□□□ 1.42
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Clip1Q922J3 1391 aa23.92■■□□□ 1.42
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa23.9■■□□□ 1.42
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa23.85■■□□□ 1.41
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Amer1Q7TS75 1132 aa23.8■■□□□ 1.4
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Golga3P55937 1487 aa23.79■■□□□ 1.4
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Os9Q8K2C7 672 aa23.77■■□□□ 1.4
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Myt1Q8CFC2 1127 aa23.76■■□□□ 1.39
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sall2Q9QX96 1004 aa23.75■■□□□ 1.39
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Eid3Q3V124 375 aa23.73■■□□□ 1.39
Gm20517-202ENSMUST00000132397 NeflP08551 543 aa23.7■■□□□ 1.38
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Kif15Q6P9L6 1387 aa23.7■■□□□ 1.38
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa23.57■■□□□ 1.36
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa23.56■■□□□ 1.36
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sycp2Q9CUU3 1500 aa23.56■■□□□ 1.36
Gm20517-202ENSMUST00000132397 ScribQ80U72 1612 aa23.55■■□□□ 1.36
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ercc6F8VPZ5 1481 aa23.55■■□□□ 1.36
Gm20517-202ENSMUST00000132397 BlmO88700 1416 aa23.45■■□□□ 1.34
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Setd5Q5XJV7 1441 aa23.45■■□□□ 1.34
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Anks4bQ8K3X6 423 aa23.44■■□□□ 1.34
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zbtb4Q5F293 982 aa23.41■■□□□ 1.34
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Chic2Q9D9G3 165 aa23.41■■□□□ 1.34
Gm20517-202ENSMUST00000132397 4933416C03RikQ3V063 378 aa23.4■■□□□ 1.34
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Erich6D3Z6S9 713 aa23.37■■□□□ 1.33
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ccer2J3QPU5 274 aa23.35■■□□□ 1.33
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ccdc18Q640L5 1455 aa23.34■■□□□ 1.33
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa23.32■■□□□ 1.32
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Anp32aO35381 247 aa23.3■■□□□ 1.32
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Csrnp3P59055 597 aa23.3■■□□□ 1.32
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa23.3■■□□□ 1.32
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rtl5Q5DTT4 599 aa23.3■■□□□ 1.32
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm13697A2AK42 830 aa23.26■■□□□ 1.31
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm38655A0A286YDK6 273 aa23.25■■□□□ 1.31
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Crybg2B7ZCC2 1516 aa23.25■■□□□ 1.31
Gm20517-202ENSMUST00000132397 CftrP26361 1476 aa23.16■■□□□ 1.3
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Eea1Q8BL66 1411 aa23.15■■□□□ 1.3
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Atp1b4Q99ME6 356 aa23.11■■□□□ 1.29
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Smarca2Q6DIC0 1577 aa23.11■■□□□ 1.29
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Plppr3Q7TPB0 716 aa23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 66.3 ms