Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA53

Pds5b, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5bQ4VA53 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC73.57■■■■■ 9.37
Pds5bQ4VA53 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC68.65■■■■■ 8.58
Pds5bQ4VA53 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC67.38■■■■■ 8.38
Pds5bQ4VA53 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC64.43■■■■■ 7.9
Pds5bQ4VA53 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC63.16■■■■■ 7.7
Pds5bQ4VA53 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC62.26■■■■■ 7.56
Pds5bQ4VA53 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC62.06■■■■■ 7.53
Pds5bQ4VA53 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC61.68■■■■■ 7.46
Pds5bQ4VA53 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.67■■■■■ 7.46
Pds5bQ4VA53 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.6■■■■■ 7.45
Pds5bQ4VA53 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC61.27■■■■■ 7.4
Pds5bQ4VA53 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC60.4■■■■■ 7.26
Pds5bQ4VA53 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.96■■■■■ 7.19
Pds5bQ4VA53 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC59.89■■■■■ 7.18
Pds5bQ4VA53 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC59.71■■■■■ 7.15
Pds5bQ4VA53 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.66■■■■■ 7.14
Pds5bQ4VA53 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59■■■■■ 7.04
Pds5bQ4VA53 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.75■■■■■ 7
Pds5bQ4VA53 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC58.55■■■■■ 6.96
Pds5bQ4VA53 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.49■■■■■ 6.95
Pds5bQ4VA53 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC58.46■■■■■ 6.95
Pds5bQ4VA53 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC58.46■■■■■ 6.95
Pds5bQ4VA53 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC57.41■■■■■ 6.78
Pds5bQ4VA53 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC57.17■■■■■ 6.74
Pds5bQ4VA53 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC57.06■■■■■ 6.72
Pds5bQ4VA53 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.58■■■■■ 6.65
Pds5bQ4VA53 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC56.52■■■■■ 6.64
Pds5bQ4VA53 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC56.52■■■■■ 6.64
Pds5bQ4VA53 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.31■■■■■ 6.6
Pds5bQ4VA53 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC56.23■■■■■ 6.59
Pds5bQ4VA53 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.02■■■■■ 6.56
Pds5bQ4VA53 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.02■■■■■ 6.56
Pds5bQ4VA53 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC56.01■■■■■ 6.56
Pds5bQ4VA53 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.92■■■■■ 6.54
Pds5bQ4VA53 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC55.72■■■■■ 6.51
Pds5bQ4VA53 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC55.7■■■■■ 6.51
Pds5bQ4VA53 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC55.63■■■■■ 6.5
Pds5bQ4VA53 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC55.59■■■■■ 6.49
Pds5bQ4VA53 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.55■■■■■ 6.48
Pds5bQ4VA53 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.52■■■■■ 6.48
Pds5bQ4VA53 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC55.43■■■■■ 6.46
Pds5bQ4VA53 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.26■■■■■ 6.44
Pds5bQ4VA53 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC55.25■■■■■ 6.43
Pds5bQ4VA53 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC55.21■■■■■ 6.43
Pds5bQ4VA53 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC55.21■■■■■ 6.43
Pds5bQ4VA53 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.14■■■■■ 6.42
Pds5bQ4VA53 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC55.13■■■■■ 6.42
Pds5bQ4VA53 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.95■■■■■ 6.39
Pds5bQ4VA53 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC54.94■■■■■ 6.39
Pds5bQ4VA53 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC54.88■■■■■ 6.38
Pds5bQ4VA53 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC54.87■■■■■ 6.37
Pds5bQ4VA53 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC54.59■■■■■ 6.33
Pds5bQ4VA53 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.58■■■■■ 6.33
Pds5bQ4VA53 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.54■■■■■ 6.32
Pds5bQ4VA53 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC54.52■■■■■ 6.32
Pds5bQ4VA53 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC54.27■■■■■ 6.28
Pds5bQ4VA53 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.13■■■■■ 6.26
Pds5bQ4VA53 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC54.1■■■■■ 6.25
Pds5bQ4VA53 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC54.07■■■■■ 6.25
Pds5bQ4VA53 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC54.06■■■■■ 6.24
Pds5bQ4VA53 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.99■■■■■ 6.23
Pds5bQ4VA53 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.7■■■■■ 6.19
Pds5bQ4VA53 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.68■■■■■ 6.18
Pds5bQ4VA53 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC53.63■■■■■ 6.18
Pds5bQ4VA53 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.53■■■■■ 6.16
Pds5bQ4VA53 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.43■■■■■ 6.14
Pds5bQ4VA53 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC53.4■■■■■ 6.14
Pds5bQ4VA53 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC53.36■■■■■ 6.13
Pds5bQ4VA53 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC53.36■■■■■ 6.13
Pds5bQ4VA53 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.33■■■■■ 6.13
Pds5bQ4VA53 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC53.17■■■■■ 6.1
Pds5bQ4VA53 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.16■■■■■ 6.1
Pds5bQ4VA53 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.08■■■■■ 6.09
Pds5bQ4VA53 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.07■■■■■ 6.09
Pds5bQ4VA53 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC53.04■■■■■ 6.08
Pds5bQ4VA53 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.82■■■■■ 6.05
Pds5bQ4VA53 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.76■■■■■ 6.04
Pds5bQ4VA53 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC52.72■■■■■ 6.03
Pds5bQ4VA53 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.63■■■■■ 6.02
Pds5bQ4VA53 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.57■■■■■ 6.01
Pds5bQ4VA53 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.57■■■■■ 6.01
Pds5bQ4VA53 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC52.51■■■■■ 6
Pds5bQ4VA53 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC52.49■■■■■ 5.99
Pds5bQ4VA53 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC52.45■■■■■ 5.99
Pds5bQ4VA53 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.43■■■■■ 5.98
Pds5bQ4VA53 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.42■■■■■ 5.98
Pds5bQ4VA53 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.4■■■■■ 5.98
Pds5bQ4VA53 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.34■■■■■ 5.97
Pds5bQ4VA53 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC52.33■■■■■ 5.97
Pds5bQ4VA53 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC52.33■■■■■ 5.97
Pds5bQ4VA53 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.31■■■■■ 5.96
Pds5bQ4VA53 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC52.26■■■■■ 5.96
Pds5bQ4VA53 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC52.22■■■■■ 5.95
Pds5bQ4VA53 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC52.21■■■■■ 5.95
Pds5bQ4VA53 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC52.19■■■■■ 5.95
Pds5bQ4VA53 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.17■■■■■ 5.94
Pds5bQ4VA53 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC52.16■■■■■ 5.94
Pds5bQ4VA53 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.13■■■■■ 5.94
Pds5bQ4VA53 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC52.08■■■■■ 5.93
Pds5bQ4VA53 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.05■■■■■ 5.92
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