RNA–Protein interactions for RNA: snR46

snR46, Transcript of H/ACA box small nucleolar RNA (snoRNA), yeast

Gene snR46, Length 197 nt, Biotype snoRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
snR46	snR46	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
snR46	snR46	LAM1	P38851	1228 aa		2.94	□□□□□ -1.94
snR46	snR46	SAP155	P43612	1002 aa		2.94	□□□□□ -1.94
snR46	snR46	YML122C	Q03207	126 aa		2.94	□□□□□ -1.94
snR46	snR46	SGD1	Q06132	899 aa		2.94	□□□□□ -1.94
snR46	snR46	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
snR46	snR46	PUS9	Q12069	462 aa		2.94	□□□□□ -1.94
snR46	snR46	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
snR46	snR46	MEF2	P39677	819 aa		2.93	□□□□□ -1.94
snR46	snR46	MSE1	P48525	536 aa		2.93	□□□□□ -1.94
snR46	snR46	ENV11	P53246	860 aa		2.93	□□□□□ -1.94
snR46	snR46	KAR5	Q04746	504 aa		2.93	□□□□□ -1.94
snR46	snR46	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.92	□□□□□ -1.94	not detected
snR46	snR46	EXO5	P38289	585 aa		2.92	□□□□□ -1.94
snR46	snR46	GCN5	Q03330	439 aa		2.92	□□□□□ -1.94
snR46	snR46	ROT1	Q03691	256 aa		2.92	□□□□□ -1.94
snR46	snR46	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
snR46	snR46	RSC58	Q07979	502 aa		2.92	□□□□□ -1.94
snR46	snR46	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
snR46	snR46	NEM1	P38757	446 aa		2.91	□□□□□ -1.94
snR46	snR46	HNT2	P49775	206 aa		2.91	□□□□□ -1.94
snR46	snR46	RSB1	Q08417	382 aa		2.91	□□□□□ -1.94
snR46	snR46	HCM1	P25364	564 aa		2.9	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	YJL045W	P47052	634 aa		2.9	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	CDC55	Q00362	526 aa		2.9	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	TRS120	Q04183	1289 aa		2.9	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	YSC84	P32793	468 aa		2.89	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	XKS1	P42826	600 aa		2.89	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	SUN4	P53616	420 aa		2.89	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	PEX13	P80667	386 aa		2.89	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	YDR132C	Q03900	495 aa		2.89	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	ACF4	P47129	309 aa		2.88	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	2.88	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	COQ4	O13525	335 aa		2.87	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	MSH3	P25336	1018 aa		2.87	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	CCZ1	P38273	704 aa		2.87	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	2.87	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	CTF4	Q01454	927 aa		2.87	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	RXT3	Q07458	294 aa		2.87	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	LEO1	P38439	464 aa		2.86	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	AIM21	P40563	679 aa		2.86	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	VPS53	P47061	822 aa		2.86	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	RSM26	P47141	266 aa		2.86	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	ATG1	P53104	897 aa		2.86	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	SLI1	P53304	468 aa		2.86	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	RSM24	Q03976	319 aa		2.86	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	TMA10	Q06177	86 aa		2.86	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	MNL2	Q12205	849 aa		2.86	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	DOM34	P33309	386 aa		2.85	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	SAM37	P50110	327 aa		2.85	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	PLB2	Q03674	706 aa		2.85	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	YCS4	Q06156	1176 aa		2.85	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	CMP2	P14747	604 aa		2.84	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	SQT1	P35184	431 aa		2.84	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	DUS4	Q06063	367 aa		2.84	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	GPB1	Q08886	897 aa		2.84	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	NTO1	Q12311	748 aa		2.84	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	SPO21	Q12411	609 aa		2.84	□□□□□ -1.95
snR46	snR46	GAL10	P04397	699 aa		2.83	□□□□□ -1.96
snR46	snR46	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.83	□□□□□ -1.96	not detected
snR46	snR46	KIP1	P28742	1111 aa		2.83	□□□□□ -1.96
snR46	snR46	LST4	P34239	828 aa		2.83	□□□□□ -1.96
snR46	snR46	ADD66	P36040	267 aa		2.83	□□□□□ -1.96
snR46	snR46	PHO23	P50947	330 aa		2.83	□□□□□ -1.96
snR46	snR46	TNA1	P53322	534 aa		2.83	□□□□□ -1.96
snR46	snR46	RAD53	P22216	821 aa		2.82	□□□□□ -1.96
snR46	snR46	STE11	P23561	717 aa		2.82	□□□□□ -1.96
snR46	snR46	CDC20	P26309	610 aa		2.82	□□□□□ -1.96
snR46	snR46	RFC5	P38251	354 aa		2.82	□□□□□ -1.96
snR46	snR46	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
snR46	snR46	GPB2	P39717	880 aa		2.82	□□□□□ -1.96
snR46	snR46	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
snR46	snR46	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
snR46	snR46	RKM2	Q03942	479 aa		2.81	□□□□□ -1.96
snR46	snR46	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
snR46	snR46	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.81	□□□□□ -1.96	not detected
snR46	snR46	PTC5	Q12511	572 aa		2.81	□□□□□ -1.96
snR46	snR46	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
snR46	snR46	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
snR46	snR46	PEX28	P38848	579 aa		2.8	□□□□□ -1.96
snR46	snR46	EST2	Q06163	884 aa		2.8	□□□□□ -1.96
snR46	snR46	APL1	P27351	700 aa		2.79	□□□□□ -1.96
snR46	snR46	PIK1	P39104	1066 aa		2.79	□□□□□ -1.96
snR46	snR46	UBA2	P52488	636 aa		2.79	□□□□□ -1.96
snR46	snR46	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
snR46	snR46	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
snR46	snR46	BAP2	P38084	609 aa		2.78	□□□□□ -1.96

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 35.8 ms