RNA–Protein interactions for RNA: YOL076W

MDM20, Transcript of Non-catalytic subunit of the NatB N-terminal acetyltransferase, yeast

Gene MDM20, Length 2,391 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDM20	YOL076W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	XKS1	P42826	600 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	HNT2	P49775	206 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	ORC3	P54790	616 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	VPS35	P34110	944 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	SPT20	P50875	604 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	TNA1	P53322	534 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	TOD6	P34219	525 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	RSM24	Q03976	319 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	PEX7	P39108	375 aa		3.09	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	SAP155	P43612	1002 aa		3.09	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	SLS1	P42900	643 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	CTR9	P89105	1077 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	CDA2	Q06703	312 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	SOD2	P00447	233 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	RKM2	Q03942	479 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	DAL4	Q04895	635 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	KTR2	P33550	425 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	ADD66	P36040	267 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	ERP5	P38819	212 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	EAR1	Q03212	550 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	MSH3	P25336	1018 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	SEC20	P28791	383 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	PEX28	P38848	579 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.06	□□□□□ -1.92	not detected
MDM20	YOL076W	SGD1	Q06132	899 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	NUT2	Q06213	157 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	PNS1	Q12412	539 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	NEM1	P38757	446 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	EST2	Q06163	884 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	PTC5	Q12511	572 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	RAD27	P26793	382 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	EXO5	P38289	585 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	RSC58	Q07979	502 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	TAF13	P11747	167 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	FLR1	P38124	548 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	YJL045W	P47052	634 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	YPL277C	Q08989	487 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	COB	P00163	385 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	YSC84	P32793	468 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	SEA4	P38164	1038 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	RXT3	Q07458	294 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	YPL260W	Q08977	551 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	HDA2	Q06629	674 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	PIK1	P39104	1066 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	MRPS18	P42847	217 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MDM20	YOL076W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	YHL050C	P38721	697 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	YHR219W	P38900	624 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	ULP1	Q02724	621 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	SPO21	Q12411	609 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	RFC5	P38251	354 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	MGE1	P38523	228 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	ADI1	Q03677	179 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	DUR3	P33413	735 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	MCD1	Q12158	566 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	LAM1	P38851	1228 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	MDJ2	P42834	146 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	APL1	P27351	700 aa		3	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	KIP1	P28742	1111 aa		3	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	TRM2	P33753	639 aa		3	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	IOC3	P43596	787 aa		3	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	GCN5	Q03330	439 aa		3	□□□□□ -1.93
MDM20	YOL076W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93

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