RNA–Protein interactions for RNA: YLL047W

YLL047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLL047W, Length 384 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL047WYLL047W ALG6Q12001 544 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
YLL047WYLL047W MMM1P41800 426 aa6.8□□□□□ -1.32
YLL047WYLL047W CIT3P43635 486 aa6.8□□□□□ -1.32
YLL047WYLL047W SPO74P45819 413 aa6.8□□□□□ -1.32
YLL047WYLL047W VPS53P47061 822 aa6.8□□□□□ -1.32
YLL047WYLL047W EST2Q06163 884 aa6.8□□□□□ -1.32
YLL047WYLL047W HDA2Q06629 674 aa6.8□□□□□ -1.32
YLL047WYLL047W PEP7P32609 515 aa6.79□□□□□ -1.32
YLL047WYLL047W ELA1P53861 379 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
YLL047WYLL047W HRK1Q08732 759 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
YLL047WYLL047W RTT10Q08924 1013 aa6.79□□□□□ -1.32
YLL047WYLL047W RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
YLL047WYLL047W RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
YLL047WYLL047W NFS1P25374 497 aa6.78□□□□□ -1.32
YLL047WYLL047W NAM7P30771 971 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
YLL047WYLL047W PET112P33893 541 aa6.78□□□□□ -1.32
YLL047WYLL047W TMA46Q12000 345 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
YLL047WYLL047W CLN2P20438 545 aa6.77□□□□□ -1.33
YLL047WYLL047W HXT13P39924 564 aa6.77□□□□□ -1.33
YLL047WYLL047W HXT17P53631 564 aa6.77□□□□□ -1.33
YLL047WYLL047W HXT15P54854 567 aa6.77□□□□□ -1.33
YLL047WYLL047W RSA3Q05942 220 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
YLL047WYLL047W MRL1Q06815 381 aa6.77□□□□□ -1.33
YLL047WYLL047W GCR1P07261 785 aa6.76□□□□□ -1.33
YLL047WYLL047W MED7Q08278 222 aa6.76□□□□□ -1.33
YLL047WYLL047W CDC34P14682 295 aa6.75□□□□□ -1.33
YLL047WYLL047W RAD27P26793 382 aa6.75□□□□□ -1.33
YLL047WYLL047W PAM1P37304 830 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
YLL047WYLL047W MET10P39692 1035 aa6.75□□□□□ -1.33
YLL047WYLL047W NSI1Q12457 570 aa6.75□□□□□ -1.33
YLL047WYLL047W SBP1P10080 294 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
YLL047WYLL047W RET1P22276 1149 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
YLL047WYLL047W AFG2P32794 780 aa6.74□□□□□ -1.33
YLL047WYLL047W QNS1P38795 714 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
YLL047WYLL047W YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
YLL047WYLL047W PUS7Q08647 676 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
YLL047WYLL047W MKK2P32491 506 aa6.73□□□□□ -1.33
YLL047WYLL047W DUT1P33317 147 aa6.73□□□□□ -1.33
YLL047WYLL047W ROD1Q02805 837 aa6.73□□□□□ -1.33
YLL047WYLL047W WHI3P34761 661 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
YLL047WYLL047W RGD1P38339 666 aa6.72□□□□□ -1.33
YLL047WYLL047W RCM1P53972 490 aa6.72□□□□□ -1.33
YLL047WYLL047W YPL260WQ08977 551 aa6.72□□□□□ -1.33
YLL047WYLL047W PIN2Q12057 282 aa6.72□□□□□ -1.33
YLL047WYLL047W YVC1Q12324 675 aa6.72□□□□□ -1.33
YLL047WYLL047W SYP1P25623 870 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W YKR073CP36153 106 aa6.71□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W OYE3P41816 400 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W YGR130CP53278 816 aa6.71□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W TPP1Q03796 238 aa6.71□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W CYC7P00045 113 aa6.7□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W TRP3P00937 484 aa6.7□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W DBP5P20449 482 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W ALG3P38179 458 aa6.7□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W RPN3P40016 523 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W CNN1P43618 361 aa6.7□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W NOP7P53261 605 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W VPS16Q03308 798 aa6.7□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W PTC5Q12511 572 aa6.7□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W TOS1P38288 455 aa6.69□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W KRI1P42846 591 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W INP52P50942 1183 aa6.69□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W YNR063WP53749 607 aa6.69□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W EAR1Q03212 550 aa6.69□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W DED1P06634 604 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W SRO9P25567 434 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W LYP1P32487 611 aa6.68□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data6.68□□□□□ -1.34not detected
YLL047WYLL047W RER2P35196 286 aa6.68□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W MAD1P40957 749 aa6.68□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W HNT2P49775 206 aa6.68□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W YGR053CP53234 283 aa6.68□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W YJL045WP47052 634 aa6.67□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W EEB1Q02891 456 aa6.67□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W MAG2Q06436 670 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W MDL2P33311 773 aa6.66□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W YHL012WP38709 493 aa6.66□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W PEX7P39108 375 aa6.66□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W ORC3P54790 616 aa6.66□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W TRE1Q08919 783 aa6.66□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W TRP2P00899 507 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W SAM35P14693 329 aa6.65□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W KIP1P28742 1111 aa6.65□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W YSC84P32793 468 aa6.65□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W OMA1P36163 345 aa6.65□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W MPH1P40562 993 aa6.65□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W ALO1P54783 526 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
YLL047WYLL047W COQ4O13525 335 aa6.64□□□□□ -1.35
YLL047WYLL047W GCD1P09032 578 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
YLL047WYLL047W BAP2P38084 609 aa6.64□□□□□ -1.35
YLL047WYLL047W SNF7P39929 240 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
YLL047WYLL047W TNA1P53322 534 aa6.64□□□□□ -1.35
YLL047WYLL047W TIF35Q04067 274 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
YLL047WYLL047W BRE4Q07660 1125 aa6.64□□□□□ -1.35
YLL047WYLL047W GNT1Q12096 491 aa6.64□□□□□ -1.35
YLL047WYLL047W ADP1P25371 1049 aa6.63□□□□□ -1.35
YLL047WYLL047W MAC1P35192 417 aa6.63□□□□□ -1.35
YLL047WYLL047W TYW3P53177 273 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.2 ms