RNA–Protein interactions for RNA: YKL061W

BLI1, Transcript of Subunit of the BLOC-1 complex involved in endosomal maturation, yeast

Gene BLI1, Length 342 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLI1	YKL061W	BSC2	Q05611	235 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BLI1	YKL061W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
BLI1	YKL061W	SGD1	Q06132	899 aa		3.9	□□□□□ -1.79
BLI1	YKL061W	YNL011C	P53980	444 aa		3.89	□□□□□ -1.79
BLI1	YKL061W	MNL2	Q12205	849 aa		3.89	□□□□□ -1.79
BLI1	YKL061W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
BLI1	YKL061W	ROT1	Q03691	256 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BLI1	YKL061W	RSC58	Q07979	502 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BLI1	YKL061W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
BLI1	YKL061W	YOR352W	Q08816	343 aa		3.88	□□□□□ -1.79
BLI1	YKL061W	SPS1	P08458	490 aa		3.87	□□□□□ -1.79
BLI1	YKL061W	DMA2	P53924	522 aa		3.87	□□□□□ -1.79
BLI1	YKL061W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
BLI1	YKL061W	PLB2	Q03674	706 aa		3.86	□□□□□ -1.79
BLI1	YKL061W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
BLI1	YKL061W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
BLI1	YKL061W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
BLI1	YKL061W	HCM1	P25364	564 aa		3.85	□□□□□ -1.79
BLI1	YKL061W	XKS1	P42826	600 aa		3.85	□□□□□ -1.79
BLI1	YKL061W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
BLI1	YKL061W	YNR063W	P53749	607 aa		3.85	□□□□□ -1.79
BLI1	YKL061W	DUS4	Q06063	367 aa		3.85	□□□□□ -1.79
BLI1	YKL061W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
BLI1	YKL061W	CDC55	Q00362	526 aa		3.84	□□□□□ -1.79
BLI1	YKL061W	TRS120	Q04183	1289 aa		3.84	□□□□□ -1.79
BLI1	YKL061W	KAR5	Q04746	504 aa		3.84	□□□□□ -1.79
BLI1	YKL061W	TMA10	Q06177	86 aa		3.84	□□□□□ -1.79
BLI1	YKL061W	RAD53	P22216	821 aa		3.83	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	YSC84	P32793	468 aa		3.83	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	HSE1	P38753	452 aa		3.83	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.82	□□□□□ -1.8	not detected
BLI1	YKL061W	LST4	P34239	828 aa		3.82	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	LAP2	Q10740	671 aa		3.82	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	SPO21	Q12411	609 aa		3.82	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	CHS7	P38843	316 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	SHU2	P38957	223 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	AIM21	P40563	679 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	PHO23	P50947	330 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	ENV11	P53246	860 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	CTF4	Q01454	927 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	NTO1	Q12311	748 aa		3.81	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	MSH3	P25336	1018 aa		3.8	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	CDC20	P26309	610 aa		3.8	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	ATG1	P53104	897 aa		3.8	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	DOM34	P33309	386 aa		3.79	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	PEX13	P80667	386 aa		3.79	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	GAL10	P04397	699 aa		3.78	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	SRM1	P21827	482 aa		3.78	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	GPB2	P39717	880 aa		3.78	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	ACF4	P47129	309 aa		3.78	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	HNT2	P49775	206 aa		3.78	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
BLI1	YKL061W	COQ4	O13525	335 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BLI1	YKL061W	KIN4	Q01919	800 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BLI1	YKL061W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
BLI1	YKL061W	GPI13	Q07830	1017 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BLI1	YKL061W	CDC6	P09119	513 aa		3.76	□□□□□ -1.81
BLI1	YKL061W	CMP2	P14747	604 aa		3.76	□□□□□ -1.81
BLI1	YKL061W	STE11	P23561	717 aa		3.76	□□□□□ -1.81
BLI1	YKL061W	UGA4	P32837	571 aa		3.76	□□□□□ -1.81
BLI1	YKL061W	ATG14	P38270	344 aa		3.76	□□□□□ -1.81
BLI1	YKL061W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
BLI1	YKL061W	KIP1	P28742	1111 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BLI1	YKL061W	RXT3	Q07458	294 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BLI1	YKL061W	GPB1	Q08886	897 aa		3.75	□□□□□ -1.81
BLI1	YKL061W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.74	□□□□□ -1.81	not detected
BLI1	YKL061W	BAP2	P38084	609 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BLI1	YKL061W	CCZ1	P38273	704 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BLI1	YKL061W	YAP6	Q03935	383 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BLI1	YKL061W	YCS4	Q06156	1176 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BLI1	YKL061W	RSB1	Q08417	382 aa		3.74	□□□□□ -1.81
BLI1	YKL061W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
BLI1	YKL061W	VPS53	P47061	822 aa		3.73	□□□□□ -1.81
BLI1	YKL061W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
BLI1	YKL061W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
BLI1	YKL061W	SNF5	P18480	905 aa		3.72	□□□□□ -1.81
BLI1	YKL061W	AFG2	P32794	780 aa		3.72	□□□□□ -1.81
BLI1	YKL061W	MSS4	P38994	779 aa		3.72	□□□□□ -1.81
BLI1	YKL061W	RSM26	P47141	266 aa		3.72	□□□□□ -1.81
BLI1	YKL061W	TNA1	P53322	534 aa		3.72	□□□□□ -1.81
BLI1	YKL061W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
BLI1	YKL061W	FRT1	Q99332	602 aa		3.72	□□□□□ -1.81
BLI1	YKL061W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	ADD66	P36040	267 aa		3.71	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	RDH54	P38086	958 aa		3.71	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	PIK1	P39104	1066 aa		3.71	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	RKM2	Q03942	479 aa		3.71	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	RSM24	Q03976	319 aa		3.71	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	YLR224W	Q05947	369 aa		3.71	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	PPM2	Q08282	695 aa		3.71	□□□□□ -1.82
BLI1	YKL061W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.71	□□□□□ -1.82	not detected

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 28.8 ms