RNA–Protein interactions for RNA: YJL212C

OPT1, Transcript of Proton-coupled oligopeptide transporter of the plasma membrane, yeast

Gene OPT1, Length 2,400 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
OPT1	YJL212C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	NUT1	P53114	1132 aa		7.27	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	YML131W	Q03102	365 aa		7.27	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	LDH1	P38139	375 aa		7.27	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	APM2	P38700	605 aa		7.27	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	GEM1	P39722	662 aa		7.27	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	RRN7	P40992	514 aa		7.27	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	YNL165W	P53891	406 aa		7.27	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.27	□□□□□ -1.25	not detected
OPT1	YJL212C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	INH1	P01097	85 aa		7.26	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	TRE2	Q08693	809 aa		7.26	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	MOD5	P07884	428 aa		7.26	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	MCM1	P11746	286 aa		7.26	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	VPS5	Q92331	675 aa		7.26	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	DBF20	P32328	564 aa		7.25	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	PTP2	P29461	750 aa		7.25	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.25	□□□□□ -1.25	not detected
OPT1	YJL212C	YHL041W	P38730	149 aa		7.25	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	XDJ1	P39102	459 aa		7.25	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	UBA2	P52488	636 aa		7.25	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	HBN1	Q96VH4	193 aa		7.25	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	KTR4	P38131	464 aa		7.24	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	VBA3	P25594	458 aa		7.23	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	LYP1	P32487	611 aa		7.23	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	SWI3	P32591	825 aa		7.23	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	FBP26	P32604	452 aa		7.23	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	CCC2	P38995	1004 aa		7.23	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	QDR2	P40474	542 aa		7.23	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	HFD1	Q04458	532 aa		7.23	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	SSP2	Q08646	371 aa		7.23	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	WSC3	Q12215	556 aa		7.23	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		7.22	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	NIC96	P34077	839 aa		7.22	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	MBP1	P39678	833 aa		7.22	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	YGL140C	P53120	1219 aa		7.22	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	REH1	Q06709	432 aa		7.22	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	YPL066W	Q12194	479 aa		7.22	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		7.22	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		7.22	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	DYS1	P38791	387 aa		7.22	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	DSS1	P39112	969 aa		7.22	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	MNT3	P40549	630 aa		7.22	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	MSH6	Q03834	1242 aa		7.22	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	MCM10	P32354	571 aa		7.21	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	RKM3	P38222	552 aa		7.21	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	FIR1	P40020	876 aa		7.21	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	MET13	P53128	600 aa		7.21	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	YDR056C	Q12025	205 aa		7.21	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	WTM2	Q12206	467 aa		7.21	□□□□□ -1.25
OPT1	YJL212C	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	BSD2	P38356	321 aa		7.21	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	ESL1	P40456	1118 aa		7.2	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	GRC3	Q07845	632 aa		7.2	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	HOM3	P10869	527 aa		7.2	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	PTH2	P34222	208 aa		7.2	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	PEX28	P38848	579 aa		7.2	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	TAF1	P46677	1066 aa		7.2	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	HEH2	Q03281	663 aa		7.2	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	PCL2	P25693	308 aa		7.19	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	TFC3	P34111	1160 aa		7.19	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	TBS1	P38114	1094 aa		7.19	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	SAP155	P43612	1002 aa		7.19	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	PSR2	Q07949	397 aa		7.19	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	KCC4	P25389	1037 aa		7.19	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	DAL3	P32459	195 aa		7.19	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	PAN5	P38787	379 aa		7.19	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	SIW14	P53965	281 aa		7.19	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	INO1	P11986	533 aa		7.18	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	MLF3	P32047	452 aa		7.18	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	JNM1	P36224	373 aa		7.18	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	MUM2	P38236	366 aa		7.18	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	NIT2	P47016	307 aa		7.18	□□□□□ -1.26
OPT1	YJL212C	RSM26	P47141	266 aa		7.18	□□□□□ -1.26

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