RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W RGA2Q06407 1009 aa5.16□□□□□ -1.58
HCA4YJL033W SIN3P22579 1536 aa5.16□□□□□ -1.58
HCA4YJL033W XKS1P42826 600 aa5.15□□□□□ -1.58
HCA4YJL033W COQ2P32378 372 aa5.15□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W PGM1P33401 570 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W YGR045CP53229 120 aa5.15□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W GIC2Q06648 383 aa5.15□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W HEM13P11353 328 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W ADD66P36040 267 aa5.14□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W GPT2P36148 743 aa5.14□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W SAF1P38352 637 aa5.14□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W LAP2Q10740 671 aa5.14□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W PET112P33893 541 aa5.14□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W MNR2P35724 969 aa5.14□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W AKR1P39010 764 aa5.14□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W YAR028WP39548 234 aa5.14□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W SPO74P45819 413 aa5.14□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W RKM2Q03942 479 aa5.14□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W NAM7P30771 971 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W HSE1P38753 452 aa5.13□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W ELA1P53861 379 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W EST2Q06163 884 aa5.13□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W ATG2P53855 1592 aa5.13□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W NNK1P36003 928 aa5.13□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W ENT3P47160 408 aa5.13□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W HDA2Q06629 674 aa5.13□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W MRL1Q06815 381 aa5.13□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data5.13□□□□□ -1.59not detected
HCA4YJL033W GCR1P07261 785 aa5.12□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W MSH4P40965 878 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W KOG1P38873 1557 aa5.12□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W CHS2P14180 963 aa5.12□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W SMY2P32909 740 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W PAM1P37304 830 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W NOP7P53261 605 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W SIW14P53965 281 aa5.12□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W RTT10Q08924 1013 aa5.12□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W KAE1P36132 386 aa5.11□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W RAD27P26793 382 aa5.11□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W YNR063WP53749 607 aa5.11□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W TMA46Q12000 345 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W SCC2Q04002 1493 aa5.11□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W MYO2P19524 1574 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W POL1P13382 1468 aa5.1□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W CLN2P20438 545 aa5.1□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W NFS1P25374 497 aa5.1□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W MMM1P41800 426 aa5.1□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W ALT1P52893 592 aa5.1□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W YLR122CQ12312 125 aa5.1□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W DED1P06634 604 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W VPS53P47061 822 aa5.09□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W GNP1P48813 663 aa5.09□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W MSB1P21339 1137 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W MAD1P40957 749 aa5.09□□□□□ -1.59
HCA4YJL033W CDC34P14682 295 aa5.08□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W RET1P22276 1149 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W CIT3P43635 486 aa5.08□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W ROD1Q02805 837 aa5.08□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W SBP1P10080 294 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W HXT13P39924 564 aa5.08□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W HXT17P53631 564 aa5.08□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W HXT15P54854 567 aa5.08□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W RSA3Q05942 220 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W PIN2Q12057 282 aa5.08□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W MDS3P53094 1487 aa5.08□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W MKK2P32491 506 aa5.07□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W UFD4P33202 1483 aa5.07□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W RKR1Q04781 1562 aa5.07□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W TRM732Q03496 1420 aa5.07□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W YPK9Q12697 1472 aa5.07□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W QNS1P38795 714 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W MET10P39692 1035 aa5.07□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W PTC5Q12511 572 aa5.07□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W AFG2P32794 780 aa5.06□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W DUT1P33317 147 aa5.06□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W WHI3P34761 661 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W VPS16Q03308 798 aa5.06□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W HRK1Q08732 759 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W NSI1Q12457 570 aa5.06□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W YGR130CP53278 816 aa5.06□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W SYP1P25623 870 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W ALG3P38179 458 aa5.05□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W RCM1P53972 490 aa5.05□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W TPP1Q03796 238 aa5.05□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W MED7Q08278 222 aa5.05□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W PUS7Q08647 676 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W STH1P32597 1359 aa5.05□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W YTA7P40340 1379 aa5.05□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W RER2P35196 286 aa5.05□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W EAR1Q03212 550 aa5.05□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W PEP1P32319 1579 aa5.04□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W CNN1P43618 361 aa5.04□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W CWC24P53769 259 aa5.04□□□□□ -1.6
HCA4YJL033W YVC1Q12324 675 aa5.04□□□□□ -1.6
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