RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000122421.1

Ccsap-202, Transcript of Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccsap, Length 2,673 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccsap-202ENSMUST00000122421 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
Ccsap-202ENSMUST00000122421 PogkQ80TC5 607 aa27.62■■■□□ 2.01
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa27.62■■■□□ 2.01
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Dip2aQ8BWT5 1523 aa27.61■■■□□ 2.01
Ccsap-202ENSMUST00000122421 CatipB9EKE5 520 aa27.61■■■□□ 2.01
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Eif4a2P10630 407 aa27.61■■■□□ 2.01
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Phf23Q8BSN5 401 aa27.61■■■□□ 2.01
Ccsap-202ENSMUST00000122421 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa27.6■■■□□ 2.01
Ccsap-202ENSMUST00000122421 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa27.6■■■□□ 2.01
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Znf692Q3U381 531 aa27.6■■■□□ 2.01
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Asxl2Q8BZ32 1370 aa27.59■■■□□ 2.01
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Atg4a-psA0A0G2JFS9 396 aa27.59■■■□□ 2.01
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Erc2Q6PH08 957 aa27.59■■■□□ 2.01
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Mrps27Q8BK72 415 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Atg4aQ8C9S8 396 aa27.59■■■□□ 2.01
Ccsap-202ENSMUST00000122421 MpripP97434 1024 aa27.58■■■□□ 2.01
Ccsap-202ENSMUST00000122421 PtmaP26350 111 aa27.58■■■□□ 2.01
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Q9D2X8 372 aa27.57■■■□□ 2
Ccsap-202ENSMUST00000122421 NpatQ8BMA5 1420 aa27.56■■■□□ 2
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Mdc1Q5PSV9 1707 aa27.55■■■□□ 2
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Rnf123Q5XPI3 1314 aa27.55■■■□□ 2
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa27.55■■■□□ 2
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Clcn1Q64347 994 aa27.54■■■□□ 2
Ccsap-202ENSMUST00000122421 4931400O07RikQ9D4M5 137 aa27.54■■■□□ 2
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Tpm2P58774 284 aa27.53■■■□□ 2
Ccsap-202ENSMUST00000122421 DmtnQ9WV69 405 aa27.53■■■□□ 2
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Zdhhc9P59268 364 aa27.52■■■□□ 2
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Zkscan16A2ALW2 728 aa27.51■■□□□ 1.99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Psme1P97371 249 aa27.51■■□□□ 1.99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Erich6bQ9D4S6 220 aa27.51■■□□□ 1.99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ap3b2Q9JME5 1082 aa27.51■■□□□ 1.99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Astn2Q80Z10 1352 aa27.5■■□□□ 1.99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa27.5■■□□□ 1.99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Pdcl2Q78Y63 240 aa27.5■■□□□ 1.99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Fez1Q8K0X8 392 aa27.5■■□□□ 1.99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Pibf1E9Q6K3 756 aa27.49■■□□□ 1.99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Zkscan2G3X952 960 aa27.49■■□□□ 1.99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cps1Q8C196 1500 aa27.48■■□□□ 1.99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Sv2bQ8BG39 683 aa27.48■■□□□ 1.99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa27.48■■□□□ 1.99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Zfp777B9EKF4 885 aa27.48■■□□□ 1.99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Med1Q925J9 1575 aa27.47■■□□□ 1.99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Bcar3Q9QZK2 820 aa27.47■■□□□ 1.99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Gm9992B2RWK3 458 aa27.46■■□□□ 1.99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ggnbp2Q5SV77 696 aa27.46■■□□□ 1.99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Unc93aQ710D3 458 aa27.46■■□□□ 1.99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Gdpd2Q9ESM6 539 aa27.46■■□□□ 1.99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 NexnQ7TPW1 607 aa27.46■■□□□ 1.99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Glipr1l2Q9CQ35 332 aa27.45■■□□□ 1.99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 VgfQ0VGU4 617 aa27.45■■□□□ 1.98
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Vwa3bJ9JI28 736 aa27.44■■□□□ 1.98
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ush1cQ9ES64 910 aa27.44■■□□□ 1.98
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Txndc2Q6P902 515 aa27.44■■□□□ 1.98
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa27.44■■□□□ 1.98
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Nphp1Q9QY53 687 aa27.44■■□□□ 1.98
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Tet3Q8BG87 1668 aa27.43■■□□□ 1.98
Ccsap-202ENSMUST00000122421 LlphQ9D945 130 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
Ccsap-202ENSMUST00000122421 MccE9PWI3 1003 aa27.43■■□□□ 1.98
Ccsap-202ENSMUST00000122421 AnlnQ8K298 1121 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
Ccsap-202ENSMUST00000122421 RestQ8VIG1 1082 aa27.42■■□□□ 1.98
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Atp6v1dP57746 247 aa27.41■■□□□ 1.98
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Gm45015A0A140LII9 184 aa27.4■■□□□ 1.98
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Gm18336A0A140LIU8 765 aa27.4■■□□□ 1.98
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Srgap3Q812A2 1099 aa27.4■■□□□ 1.98
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa27.4■■□□□ 1.98
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa27.4■■□□□ 1.98
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Prim1P20664 417 aa27.39■■□□□ 1.98
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Filip1lQ6P6L0 1131 aa27.39■■□□□ 1.98
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Sirt1Q923E4 737 aa27.39■■□□□ 1.98
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
Ccsap-202ENSMUST00000122421 RictorQ6QI06 1708 aa27.39■■□□□ 1.98
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Znf335A2A5K6 1337 aa27.39■■□□□ 1.98
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Nol8Q3UHX0 1147 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Syce3B5KM66 88 aa27.38■■□□□ 1.97
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ppp1r42Q8R1Z4 357 aa27.38■■□□□ 1.97
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Gripap1Q8VD04 806 aa27.38■■□□□ 1.97
Ccsap-202ENSMUST00000122421 CemipQ8BI06 1361 aa27.38■■□□□ 1.97
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Becn1O88597 448 aa27.37■■□□□ 1.97
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Kif4P33174 1231 aa27.37■■□□□ 1.97
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Anapc15P60007 132 aa27.37■■□□□ 1.97
Ccsap-202ENSMUST00000122421 St18Q80TY4 1045 aa27.37■■□□□ 1.97
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Slit2Q9R1B9 1521 aa27.36■■□□□ 1.97
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Dip2bQ3UH60 1574 aa27.36■■□□□ 1.97
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Hmox1P14901 289 aa27.36■■□□□ 1.97
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Tex2Q6ZPJ0 1128 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Igsf1Q7TQA1 1317 aa27.36■■□□□ 1.97
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Hoxa7P02830 229 aa27.36■■□□□ 1.97
Ccsap-202ENSMUST00000122421 NalcnQ8BXR5 1738 aa27.36■■□□□ 1.97
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Mmp8O70138 465 aa27.35■■□□□ 1.97
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Prune1Q8BIW1 454 aa27.35■■□□□ 1.97
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Hsp90b1P08113 802 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
Ccsap-202ENSMUST00000122421 CalcaP70160 136 aa27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.5 ms