RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000122421.1

Ccsap-202, Transcript of Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccsap, Length 2,673 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccsap-202ENSMUST00000122421 NischQ80TM9 1593 aa42.08■■■■■ 4.33
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa41.11■■■■■ 4.17
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Abcc9P70170 1546 aa40.9■■■■■ 4.14
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Abcc8B2RUS7 1588 aa39.8■■■■□ 3.96
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Rtl1Q7M732 1744 aa39.64■■■■□ 3.94
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Rhox8Q6VSS7 320 aa39.52■■■■□ 3.92
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ccdc180J3QNE4 1664 aa39■■■■□ 3.83
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa37.97■■■■□ 3.67
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP37.93■■■■□ 3.66
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Dcaf1Q80TR8 1506 aa37.31■■■■□ 3.56
Ccsap-202ENSMUST00000122421 HrcG5E8J6 738 aa37.06■■■■□ 3.52
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa36.92■■■■□ 3.5
Ccsap-202ENSMUST00000122421 ScribQ80U72 1612 aa36.78■■■■□ 3.48
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa36.55■■■■□ 3.44
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Baz1aO88379 1555 aa36.52■■■■□ 3.44
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Kdm5dQ62240 1548 aa36.25■■■■□ 3.39
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Trim41Q5NCC3 630 aa36.07■■■■□ 3.37
Ccsap-202ENSMUST00000122421 NacadQ5SWP3 1504 aa35.92■■■■□ 3.34
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Crybg2B7ZCC2 1516 aa35.77■■■■□ 3.32
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cep164Q5DU05 1446 aa35.77■■■■□ 3.32
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Pcgf6Q99NA9 353 aa35.77■■■■□ 3.32
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Smarca2Q6DIC0 1577 aa35.74■■■■□ 3.31
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Sycp2Q9CUU3 1500 aa35.1■■■■□ 3.21
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.2
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cngb1E1AZ71 1325 aa34.94■■■■□ 3.18
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Chic1Q8CBW7 227 aa34.93■■■■□ 3.18
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Gab3Q8BSM5 595 aa34.78■■■■□ 3.16
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Golga3P55937 1487 aa34.76■■■■□ 3.16
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa34.7■■■■□ 3.15
Ccsap-202ENSMUST00000122421 NefmP08553 848 aa34.68■■■■□ 3.14
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa34.65■■■■□ 3.14
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Synj1Q8CHC4 1574 aa34.54■■■■□ 3.12
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Mier1Q5UAK0 511 aa34.46■■■■□ 3.11
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Zeb1Q64318 1117 aa34.42■■■■□ 3.1
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Neurod1Q60867 357 aa34.31■■■■□ 3.08
Ccsap-202ENSMUST00000122421 CftrP26361 1476 aa34.28■■■■□ 3.08
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Top2bQ64511 1612 aa34.28■■■■□ 3.08
Ccsap-202ENSMUST00000122421 BicraF8VPZ9 1578 aa34.21■■■■□ 3.07
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa34.09■■■■□ 3.05
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Sall2Q9QX96 1004 aa34.03■■■■□ 3.04
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa33.9■■■■□ 3.02
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa33.9■■■■□ 3.02
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
Ccsap-202ENSMUST00000122421 UbtfP25976 765 aaKnown RBP33.76■■■□□ 2.99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Fmn1Q05860 1466 aa33.75■■■□□ 2.99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP33.69■■■□□ 2.98
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Anks4bQ8K3X6 423 aa33.62■■■□□ 2.97
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cep162Q6ZQ06 1403 aa33.6■■■□□ 2.97
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Wdr66E9Q743 1299 aa33.51■■■□□ 2.96
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP33.47■■■□□ 2.95
Ccsap-202ENSMUST00000122421 ClspnQ80YR7 1315 aa33.44■■■□□ 2.94
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Myt1lP97500 1187 aa33.4■■■□□ 2.94
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP33.26■■■□□ 2.91
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Npm2Q80W85 207 aa33.24■■■□□ 2.91
Ccsap-202ENSMUST00000122421 TonslQ6NZL6 1363 aa33.23■■■□□ 2.91
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP33.23■■■□□ 2.91
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Clip1Q922J3 1391 aa33.21■■■□□ 2.91
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP33.21■■■□□ 2.91
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa33.2■■■□□ 2.91
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Csrnp3P59055 597 aa33.15■■■□□ 2.9
Ccsap-202ENSMUST00000122421 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa33.15■■■□□ 2.9
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa33.08■■■□□ 2.89
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa33.03■■■□□ 2.88
Ccsap-202ENSMUST00000122421 TnnQ80Z71 1560 aa32.97■■■□□ 2.87
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP32.89■■■□□ 2.86
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa32.88■■■□□ 2.85
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Aplp2Q06335 707 aa32.86■■■□□ 2.85
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Arhgap35Q91YM2 1499 aa32.86■■■□□ 2.85
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Eea1Q8BL66 1411 aa32.77■■■□□ 2.84
Ccsap-202ENSMUST00000122421 NrkQ9R0G8 1455 aa32.76■■■□□ 2.84
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Arap1Q4LDD4 1452 aa32.72■■■□□ 2.83
Ccsap-202ENSMUST00000122421 PtprkP35822 1457 aa32.66■■■□□ 2.82
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ccdc18Q640L5 1455 aa32.64■■■□□ 2.82
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa32.64■■■□□ 2.82
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Kdm5bQ80Y84 1544 aa32.63■■■□□ 2.81
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP32.61■■■□□ 2.81
Ccsap-202ENSMUST00000122421 CenpbP27790 599 aa32.57■■■□□ 2.8
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Setd5Q5XJV7 1441 aa32.56■■■□□ 2.8
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Map3k1P53349 1493 aa32.55■■■□□ 2.8
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Lamc3Q9R0B6 1581 aa32.55■■■□□ 2.8
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Shroom4Q1W617 1475 aa32.52■■■□□ 2.8
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Frmpd1A2AKB4 1549 aa32.45■■■□□ 2.79
Ccsap-202ENSMUST00000122421 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa32.45■■■□□ 2.78
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa32.44■■■□□ 2.78
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Tiam1Q60610 1591 aa32.43■■■□□ 2.78
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Wdr62Q3U3T8 1523 aa32.42■■■□□ 2.78
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Eid3Q3V124 375 aa32.41■■■□□ 2.78
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Myt1Q8CFC2 1127 aa32.41■■■□□ 2.78
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Camsap1A2AHC3 1581 aa32.38■■■□□ 2.77
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Baz1bQ9Z277 1479 aa32.38■■■□□ 2.77
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Il27Q8K3I6 234 aa32.34■■■□□ 2.77
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Kif15Q6P9L6 1387 aa32.34■■■□□ 2.77
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Erich3F6QRE9 1637 aa32.3■■■□□ 2.76
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Naip1Q9QWK5 1403 aa32.28■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.2 ms