RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000122421.1

Ccsap-202, Transcript of Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccsap, Length 2,673 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccsap-202ENSMUST00000122421 NischQ80TM9 1593 aa42,08■■■■■ 4,33
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa41,11■■■■■ 4,17
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Abcc9P70170 1546 aa40,9■■■■■ 4,14
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Abcc8B2RUS7 1588 aa39,8■■■■□ 3,96
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Rtl1Q7M732 1744 aa39,64■■■■□ 3,94
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Rhox8Q6VSS7 320 aa39,52■■■■□ 3,92
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ccdc180J3QNE4 1664 aa39■■■■□ 3,83
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa37,97■■■■□ 3,67
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP37,93■■■■□ 3,66
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Dcaf1Q80TR8 1506 aa37,31■■■■□ 3,56
Ccsap-202ENSMUST00000122421 HrcG5E8J6 738 aa37,06■■■■□ 3,52
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP37,06■■■■□ 3,52
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa36,92■■■■□ 3,5
Ccsap-202ENSMUST00000122421 ScribQ80U72 1612 aa36,78■■■■□ 3,48
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa36,55■■■■□ 3,44
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Baz1aO88379 1555 aa36,52■■■■□ 3,44
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP36,41■■■■□ 3,42
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Kdm5dQ62240 1548 aa36,25■■■■□ 3,39
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Trim41Q5NCC3 630 aa36,07■■■■□ 3,37
Ccsap-202ENSMUST00000122421 NacadQ5SWP3 1504 aa35,92■■■■□ 3,34
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Crybg2B7ZCC2 1516 aa35,77■■■■□ 3,32
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cep164Q5DU05 1446 aa35,77■■■■□ 3,32
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Pcgf6Q99NA9 353 aa35,77■■■■□ 3,32
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Smarca2Q6DIC0 1577 aa35,74■■■■□ 3,31
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Sycp2Q9CUU3 1500 aa35,1■■■■□ 3,21
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP35,03■■■■□ 3,2
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP35,01■■■■□ 3,2
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP34,97■■■■□ 3,19
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cngb1E1AZ71 1325 aa34,94■■■■□ 3,18
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Chic1Q8CBW7 227 aa34,93■■■■□ 3,18
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Gab3Q8BSM5 595 aa34,78■■■■□ 3,16
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Golga3P55937 1487 aa34,76■■■■□ 3,16
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa34,7■■■■□ 3,15
Ccsap-202ENSMUST00000122421 NefmP08553 848 aa34,68■■■■□ 3,14
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa34,65■■■■□ 3,14
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Synj1Q8CHC4 1574 aa34,54■■■■□ 3,12
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Mier1Q5UAK0 511 aa34,46■■■■□ 3,11
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Zeb1Q64318 1117 aa34,42■■■■□ 3,1
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Neurod1Q60867 357 aa34,31■■■■□ 3,08
Ccsap-202ENSMUST00000122421 CftrP26361 1476 aa34,28■■■■□ 3,08
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Top2bQ64511 1612 aa34,28■■■■□ 3,08
Ccsap-202ENSMUST00000122421 BicraF8VPZ9 1578 aa34,21■■■■□ 3,07
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP34,18■■■■□ 3,06
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa34,09■■■■□ 3,05
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Sall2Q9QX96 1004 aa34,03■■■■□ 3,04
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa33,9■■■■□ 3,02
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa33,9■■■■□ 3,02
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP33,84■■■■□ 3,01
Ccsap-202ENSMUST00000122421 UbtfP25976 765 aaKnown RBP33,76■■■□□ 2,99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Fmn1Q05860 1466 aa33,75■■■□□ 2,99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP33,73■■■□□ 2,99
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP33,69■■■□□ 2,98
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Anks4bQ8K3X6 423 aa33,62■■■□□ 2,97
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cep162Q6ZQ06 1403 aa33,6■■■□□ 2,97
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Wdr66E9Q743 1299 aa33,51■■■□□ 2,96
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP33,47■■■□□ 2,95
Ccsap-202ENSMUST00000122421 ClspnQ80YR7 1315 aa33,44■■■□□ 2,94
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Myt1lP97500 1187 aa33,4■■■□□ 2,94
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP33,26■■■□□ 2,91
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Npm2Q80W85 207 aa33,24■■■□□ 2,91
Ccsap-202ENSMUST00000122421 TonslQ6NZL6 1363 aa33,23■■■□□ 2,91
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP33,23■■■□□ 2,91
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Clip1Q922J3 1391 aa33,21■■■□□ 2,91
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP33,21■■■□□ 2,91
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa33,2■■■□□ 2,91
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Csrnp3P59055 597 aa33,15■■■□□ 2,9
Ccsap-202ENSMUST00000122421 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa33,15■■■□□ 2,9
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa33,08■■■□□ 2,89
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa33,03■■■□□ 2,88
Ccsap-202ENSMUST00000122421 TnnQ80Z71 1560 aa32,97■■■□□ 2,87
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP32,89■■■□□ 2,86
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa32,88■■■□□ 2,85
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Aplp2Q06335 707 aa32,86■■■□□ 2,85
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Arhgap35Q91YM2 1499 aa32,86■■■□□ 2,85
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Eea1Q8BL66 1411 aa32,77■■■□□ 2,84
Ccsap-202ENSMUST00000122421 NrkQ9R0G8 1455 aa32,76■■■□□ 2,84
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Arap1Q4LDD4 1452 aa32,72■■■□□ 2,83
Ccsap-202ENSMUST00000122421 PtprkP35822 1457 aa32,66■■■□□ 2,82
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ccdc18Q640L5 1455 aa32,64■■■□□ 2,82
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa32,64■■■□□ 2,82
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Kdm5bQ80Y84 1544 aa32,63■■■□□ 2,81
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP32,61■■■□□ 2,81
Ccsap-202ENSMUST00000122421 CenpbP27790 599 aa32,57■■■□□ 2,8
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Setd5Q5XJV7 1441 aa32,56■■■□□ 2,8
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Map3k1P53349 1493 aa32,55■■■□□ 2,8
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Lamc3Q9R0B6 1581 aa32,55■■■□□ 2,8
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Shroom4Q1W617 1475 aa32,52■■■□□ 2,8
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Frmpd1A2AKB4 1549 aa32,45■■■□□ 2,79
Ccsap-202ENSMUST00000122421 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa32,45■■■□□ 2,78
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa32,44■■■□□ 2,78
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Tiam1Q60610 1591 aa32,43■■■□□ 2,78
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Wdr62Q3U3T8 1523 aa32,42■■■□□ 2,78
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Eid3Q3V124 375 aa32,41■■■□□ 2,78
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Myt1Q8CFC2 1127 aa32,41■■■□□ 2,78
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Camsap1A2AHC3 1581 aa32,38■■■□□ 2,77
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Baz1bQ9Z277 1479 aa32,38■■■□□ 2,77
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Il27Q8K3I6 234 aa32,34■■■□□ 2,77
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Kif15Q6P9L6 1387 aa32,34■■■□□ 2,77
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Erich3F6QRE9 1637 aa32,3■■■□□ 2,76
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Naip1Q9QWK5 1403 aa32,28■■■□□ 2,76
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10,2 ms