Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
Tpm2P58774 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Tpm2P58774 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Tpm2P58774 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Tpm2P58774 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Tpm2P58774 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Tpm2P58774 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Tpm2P58774 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Tpm2P58774 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Tpm2P58774 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Tpm2P58774 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Tpm2P58774 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Tpm2P58774 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Tpm2P58774 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Tpm2P58774 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Tpm2P58774 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Tpm2P58774 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Tpm2P58774 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Tpm2P58774 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Tpm2P58774 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Tpm2P58774 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Tpm2P58774 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Tpm2P58774 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Tpm2P58774 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Tpm2P58774 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Tpm2P58774 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Tpm2P58774 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Tpm2P58774 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Tpm2P58774 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Tpm2P58774 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Tpm2P58774 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Tpm2P58774 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Tpm2P58774 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Tpm2P58774 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Tpm2P58774 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Tpm2P58774 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Tpm2P58774 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Tpm2P58774 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Tpm2P58774 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Tpm2P58774 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Tpm2P58774 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Tpm2P58774 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Tpm2P58774 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Tpm2P58774 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Tpm2P58774 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Tpm2P58774 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Tpm2P58774 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Tpm2P58774 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Tpm2P58774 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Tpm2P58774 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Tpm2P58774 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Tpm2P58774 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Tpm2P58774 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Tpm2P58774 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Tpm2P58774 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Tpm2P58774 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Tpm2P58774 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Tpm2P58774 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Tpm2P58774 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Tpm2P58774 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Tpm2P58774 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Tpm2P58774 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Tpm2P58774 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Tpm2P58774 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Tpm2P58774 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Tpm2P58774 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Tpm2P58774 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Tpm2P58774 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Tpm2P58774 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Tpm2P58774 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Tpm2P58774 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Tpm2P58774 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Tpm2P58774 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Tpm2P58774 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Tpm2P58774 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Tpm2P58774 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Tpm2P58774 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Tpm2P58774 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Tpm2P58774 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Tpm2P58774 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Tpm2P58774 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Tpm2P58774 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Tpm2P58774 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Tpm2P58774 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Tpm2P58774 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Tpm2P58774 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Tpm2P58774 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Tpm2P58774 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Tpm2P58774 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Tpm2P58774 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Tpm2P58774 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Tpm2P58774 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Tpm2P58774 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Tpm2P58774 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Tpm2P58774 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Tpm2P58774 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Tpm2P58774 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Tpm2P58774 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Tpm2P58774 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Tpm2P58774 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms