RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000062829.8

Hoxa6-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa6, Length 874 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Slc12a5Q91V14 1138 aa22.71■■□□□ 1.23
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Trpc5Q9QX29 975 aa22.71■■□□□ 1.23
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Fam198bQ3UPI1 517 aa22.7■■□□□ 1.22
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Slc5a1Q8C3K6 665 aa22.69■■□□□ 1.22
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 HypkQ9CR41 129 aa22.69■■□□□ 1.22
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa22.68■■□□□ 1.22
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm7361D3Z6R1 267 aa22.68■■□□□ 1.22
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa22.68■■□□□ 1.22
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm1979E9QAN3 267 aa22.68■■□□□ 1.22
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm5862K7N5V5 267 aa22.68■■□□□ 1.22
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm10220K7N660 267 aa22.68■■□□□ 1.22
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa22.68■■□□□ 1.22
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ssfa2Q922B9 1252 aa22.68■■□□□ 1.22
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Tns2Q8CGB6 1400 aa22.67■■□□□ 1.22
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Phkg2Q9DB30 406 aa22.67■■□□□ 1.22
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Abca3Q8R420 1704 aa22.65■■□□□ 1.22
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Amotl1Q9D4H4 968 aa22.65■■□□□ 1.22
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Kcnq2Q9Z351 759 aa22.65■■□□□ 1.22
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa22.64■■□□□ 1.21
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 PappaQ8R4K8 1624 aa22.64■■□□□ 1.21
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Igsf1Q7TQA1 1317 aa22.63■■□□□ 1.21
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 NppbP40753 121 aa22.62■■□□□ 1.21
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Asic4Q7TNS7 539 aa22.62■■□□□ 1.21
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Pdzd9Q9D9M4 266 aa22.62■■□□□ 1.21
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 IncenpQ9WU62 880 aa22.62■■□□□ 1.21
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Chmp7Q8R1T1 451 aa22.61■■□□□ 1.21
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 AtrnQ9WU60 1428 aa22.61■■□□□ 1.21
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Crb1Q8VHS2 1405 aa22.6■■□□□ 1.21
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 MeiocA2AG06 965 aa22.6■■□□□ 1.21
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Phf23Q8BSN5 401 aa22.6■■□□□ 1.21
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 ErfeQ6PGN1 340 aa22.59■■□□□ 1.21
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Kcna3P16390 528 aa22.58■■□□□ 1.21
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 P2rx7Q9Z1M0 595 aa22.58■■□□□ 1.21
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 CoblQ5NBX1 1337 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Shank3Q4ACU6 1730 aa22.57■■□□□ 1.2
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Jdp2P97875 163 aa22.57■■□□□ 1.2
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa22.57■■□□□ 1.2
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Jmjd4Q8BFT6 427 aa22.57■■□□□ 1.2
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Bicdl1A0JNT9 577 aa22.56■■□□□ 1.2
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Plin1Q8CGN5 517 aa22.56■■□□□ 1.2
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ints5Q8CHT3 1018 aa22.56■■□□□ 1.2
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 TnikP83510 1323 aa22.56■■□□□ 1.2
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 PalmQ9Z0P4 383 aa22.55■■□□□ 1.2
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Aox2Q5SGK3 1345 aa22.55■■□□□ 1.2
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ubxn2bQ0KL01 331 aa22.54■■□□□ 1.2
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Fchsd2Q3USJ8 740 aa22.54■■□□□ 1.2
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Nlrp6Q91WS2 869 aa22.53■■□□□ 1.2
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Atg3Q9CPX6 314 aa22.53■■□□□ 1.2
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Tsen2Q6P7W5 460 aa22.52■■□□□ 1.2
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Stk31Q99MW1 1018 aa22.51■■□□□ 1.19
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Emilin1Q99K41 1017 aa22.5■■□□□ 1.19
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Mcm10Q0VBD2 885 aa22.49■■□□□ 1.19
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Dcaf5Q80T85 946 aa22.49■■□□□ 1.19
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Mtfr1lQ9CWE0 289 aa22.49■■□□□ 1.19
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Iqcf3Q9D498 203 aa22.49■■□□□ 1.19
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Egfem1Q8C088 590 aa22.48■■□□□ 1.19
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Tjp1P39447 1745 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 GsdmaQ9EST1 446 aa22.47■■□□□ 1.19
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Msh6P54276 1358 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Spef2Q8C9J3 1734 aa22.46■■□□□ 1.19
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm13023A2A8N2 498 aa22.46■■□□□ 1.19
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Smarcc1P97496 1104 aa22.46■■□□□ 1.19
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Spata31d1bE9QA57 1361 aa22.46■■□□□ 1.19
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Cap2Q9CYT6 476 aa22.43■■□□□ 1.18
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Col23a1Q8K4G2 532 aa22.42■■□□□ 1.18
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Chrna2Q91X60 512 aa22.42■■□□□ 1.18
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ric1Q69ZJ7 1422 aa22.41■■□□□ 1.18
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Miga2Q8BK03 593 aa22.41■■□□□ 1.18
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Pde4dQ01063 747 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Hirip3Q8BLH7 601 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Sumf1Q8R0F3 372 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Prom2Q3UUY6 835 aa22.39■■□□□ 1.17
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Zfyve9A2A8R0 1397 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Sos1Q62245 1319 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ccdc155Q80VJ8 648 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Abcc12Q80WJ6 1366 aa22.37■■□□□ 1.17
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Nkx2-3P97334 362 aa22.36■■□□□ 1.17
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Lrrc43Q3V0L5 667 aa22.36■■□□□ 1.17
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Msl1Q6PDM1 616 aa22.36■■□□□ 1.17
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Znrd1-asQ8R0E5 213 aa22.36■■□□□ 1.17
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 RtcbQ99LF4 505 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rad23bP54728 416 aa22.35■■□□□ 1.17
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Cabp2Q9JLK4 216 aa22.35■■□□□ 1.17
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 AceP09470 1312 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Magea6O89010 325 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Magea3Q6T340 320 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Adcy9P51830 1353 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ppm1fQ8CGA0 452 aa22.33■■□□□ 1.17
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Mrps5Q99N87 432 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Trpm3Q5F4S9 1721 aa22.33■■□□□ 1.17
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Sned1Q70E20 1403 aa22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.2 ms