Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU60

Atrn, Attractin, mousemouse

Predictions only

Length 1,428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrnQ9WU60 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC51■■■■■ 5,75
AtrnQ9WU60 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC47,61■■■■■ 5,21
AtrnQ9WU60 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,72■■■■■ 5,07
AtrnQ9WU60 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC44,66■■■■■ 4,74
AtrnQ9WU60 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43,71■■■■■ 4,59
AtrnQ9WU60 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,13■■■■■ 4,49
AtrnQ9WU60 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC43,01■■■■■ 4,48
AtrnQ9WU60 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,82■■■■■ 4,45
AtrnQ9WU60 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,67■■■■■ 4,42
AtrnQ9WU60 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42,66■■■■■ 4,42
AtrnQ9WU60 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC42,44■■■■■ 4,38
AtrnQ9WU60 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC41,94■■■■■ 4,3
AtrnQ9WU60 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,6■■■■■ 4,25
AtrnQ9WU60 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41,56■■■■■ 4,24
AtrnQ9WU60 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC41,46■■■■■ 4,23
AtrnQ9WU60 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,44■■■■■ 4,22
AtrnQ9WU60 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,42■■■■■ 4,22
AtrnQ9WU60 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,84■■■■■ 4,13
AtrnQ9WU60 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,74■■■■■ 4,11
AtrnQ9WU60 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC40,58■■■■■ 4,09
AtrnQ9WU60 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC40,55■■■■■ 4,08
AtrnQ9WU60 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,5■■■■■ 4,07
AtrnQ9WU60 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,49■■■■■ 4,07
AtrnQ9WU60 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC40,47■■■■■ 4,07
AtrnQ9WU60 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40■■■■□ 3,99
AtrnQ9WU60 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39,72■■■■□ 3,95
AtrnQ9WU60 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC39,63■■■■□ 3,93
AtrnQ9WU60 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,49■■■■□ 3,91
AtrnQ9WU60 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC39,21■■■■□ 3,87
AtrnQ9WU60 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,16■■■■□ 3,86
AtrnQ9WU60 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC39,1■■■■□ 3,85
AtrnQ9WU60 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,95■■■■□ 3,83
AtrnQ9WU60 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC38,93■■■■□ 3,82
AtrnQ9WU60 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,79■■■■□ 3,8
AtrnQ9WU60 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC38,78■■■■□ 3,8
AtrnQ9WU60 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38,72■■■■□ 3,79
AtrnQ9WU60 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,67■■■■□ 3,78
AtrnQ9WU60 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC38,66■■■■□ 3,78
AtrnQ9WU60 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC38,6■■■■□ 3,77
AtrnQ9WU60 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38,58■■■■□ 3,77
AtrnQ9WU60 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,55■■■■□ 3,76
AtrnQ9WU60 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC38,51■■■■□ 3,76
AtrnQ9WU60 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,45■■■■□ 3,75
AtrnQ9WU60 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC38,33■■■■□ 3,73
AtrnQ9WU60 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,31■■■■□ 3,72
AtrnQ9WU60 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC38,29■■■■□ 3,72
AtrnQ9WU60 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,26■■■■□ 3,72
AtrnQ9WU60 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38,22■■■■□ 3,71
AtrnQ9WU60 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,18■■■■□ 3,7
AtrnQ9WU60 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC38,14■■■■□ 3,7
AtrnQ9WU60 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,11■■■■□ 3,69
AtrnQ9WU60 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,11■■■■□ 3,69
AtrnQ9WU60 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC38,03■■■■□ 3,68
AtrnQ9WU60 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC38,02■■■■□ 3,68
AtrnQ9WU60 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,96■■■■□ 3,67
AtrnQ9WU60 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37,9■■■■□ 3,66
AtrnQ9WU60 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC37,82■■■■□ 3,64
AtrnQ9WU60 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37,78■■■■□ 3,64
AtrnQ9WU60 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37,61■■■■□ 3,61
AtrnQ9WU60 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,59■■■■□ 3,61
AtrnQ9WU60 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC37,55■■■■□ 3,6
AtrnQ9WU60 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
AtrnQ9WU60 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC37,46■■■■□ 3,59
AtrnQ9WU60 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC37,44■■■■□ 3,58
AtrnQ9WU60 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,38■■■■□ 3,57
AtrnQ9WU60 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,22■■■■□ 3,55
AtrnQ9WU60 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
AtrnQ9WU60 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
AtrnQ9WU60 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37,09■■■■□ 3,53
AtrnQ9WU60 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,08■■■■□ 3,53
AtrnQ9WU60 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,02■■■■□ 3,52
AtrnQ9WU60 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC37,01■■■■□ 3,51
AtrnQ9WU60 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC36,96■■■■□ 3,51
AtrnQ9WU60 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36,93■■■■□ 3,5
AtrnQ9WU60 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
AtrnQ9WU60 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
AtrnQ9WU60 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,8■■■■□ 3,48
AtrnQ9WU60 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,79■■■■□ 3,48
AtrnQ9WU60 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,76■■■■□ 3,48
AtrnQ9WU60 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,76■■■■□ 3,47
AtrnQ9WU60 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36,68■■■■□ 3,46
AtrnQ9WU60 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC36,54■■■■□ 3,44
AtrnQ9WU60 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,52■■■■□ 3,44
AtrnQ9WU60 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC36,46■■■■□ 3,43
AtrnQ9WU60 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,45■■■■□ 3,43
AtrnQ9WU60 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,44■■■■□ 3,42
AtrnQ9WU60 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,43■■■■□ 3,42
AtrnQ9WU60 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36,43■■■■□ 3,42
AtrnQ9WU60 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC36,39■■■■□ 3,42
AtrnQ9WU60 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC36,36■■■■□ 3,41
AtrnQ9WU60 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
AtrnQ9WU60 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
AtrnQ9WU60 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,31■■■■□ 3,4
AtrnQ9WU60 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
AtrnQ9WU60 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
AtrnQ9WU60 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC36,23■■■■□ 3,39
AtrnQ9WU60 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
AtrnQ9WU60 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,22■■■■□ 3,39
AtrnQ9WU60 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,21■■■■□ 3,39
AtrnQ9WU60 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36,2■■■■□ 3,39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms