RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gpc2Q8BKV1 579 aa21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Itpk1Q8BYN3 419 aa21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pitrm1Q8K411 1036 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MydgfQ9CPT4 166 aa21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Glod4Q9CPV4 298 aa21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SarnpQ9D1J3 210 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cnbd2Q9D5U8 673 aa21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcm1Q9R0L6 2025 aa21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm3604A0A087WPN2 559 aa21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Grem1O70326 184 aa21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kcnc1P15388 511 aa21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gucy2eP52785 1108 aa21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adcy6Q01341 1165 aa21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ikzf1Q03267 517 aa21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gpsm3Q3U1Z5 159 aa21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Brsk1Q5RJI5 778 aa21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Jak2Q62120 1129 aa21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zmym6Q8BS54 1249 aa21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Csnk1g3Q8C4X2 424 aa21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sept8Q8CHH9 429 aa21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Abhd11Q8K4F5 307 aa21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atg10Q8R1P4 215 aa21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bbox1Q924Y0 387 aa21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tpd52l2Q9CYZ2 220 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Upk1aQ9D132 257 aa21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Katnal2Q9D3R6 539 aa21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spatc1lQ9D9W0 342 aa21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slamf1Q9QUM4 343 aa21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Actl7aQ9QY84 440 aa21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr620E9PZ66 313 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr220E9Q050 325 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 1700024B05RikE9Q6D7 167 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tpst2O88856 376 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Smpdl3bP58242 456 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Polr3bP59470 1133 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sem1P60897 70 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wbp2P97765 261 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zbtb16Q3UQ17 673 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nr2c1Q505F1 590 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mtmr12Q80TA6 747 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pnma8aQ80VM8 430 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc36a3Q811P0 477 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r213Q8R278 384 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc6a20aQ8VDB9 592 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lgals12Q91VD1 314 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 KmoQ91WN4 479 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Golm1Q91XA2 393 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Catsper1Q91ZR5 686 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bcas2Q9D287 225 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppil6Q9D6D8 278 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mkrn2Q9ERV1 416 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dclre1aQ9JIC3 1026 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wdr54Q9R0D8 334 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Galk1Q9R0N0 392 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 B9d1Q9R1S0 204 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Smarcb1Q9Z0H3 385 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Padi3Q9Z184 664 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plxna4Q80UG2 1893 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Baz2bA2AUY4 2123 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm3526E9PZM0 191 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm11239E9Q5Z9 360 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm11237F2Z3W5 360 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm11238F2Z478 360 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Il13ra1O09030 424 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Apoa4P06728 395 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm428Q3UTE2 360 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Galnt10Q6P9S7 603 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 B430218F22RikQ8BQR5 223 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc151Q8BSN3 593 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bhlhe22Q8C6A8 355 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adamts2Q8C9W3 1213 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyp2c70Q91W64 489 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spats2lQ91WJ7 558 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rnf111Q99ML9 989 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Unc50Q9CQ61 259 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Xrn2Q9DBR1 951 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 IgtpQ9DCE9 423 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cldn19Q9ET38 224 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hao2Q9NYQ2 353 aa21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm5751A2AHC8 147 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ssxb8B1AY40 170 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Usp2O88623 613 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CidecP56198 239 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gabrr2P56476 465 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pld2P97813 933 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GaltQ03249 379 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ntrk1Q3UFB7 799 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Npas4Q8BGD7 802 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ifi205aQ8CGE8 404 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TrabdQ99JY4 376 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Med21Q9CQ39 144 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam136aQ9CR98 138 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Duoxa2Q9D311 320 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Stx12Q9ER00 274 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Angptl2Q9R045 493 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdh22Q9WTP5 813 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trpc7Q9WVC5 862 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm43518A0A0G2JGB6 165 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rundc3aO08576 446 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01810 119 aa21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.1 ms