Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43,92■■■■■ 4,62
Gpc2Q8BKV1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40,8■■■■■ 4,12
Gpc2Q8BKV1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,22■■■■■ 4,03
Gpc2Q8BKV1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38,24■■■■□ 3,71
Gpc2Q8BKV1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37,99■■■■□ 3,67
Gpc2Q8BKV1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,12■■■■□ 3,53
Gpc2Q8BKV1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37,09■■■■□ 3,53
Gpc2Q8BKV1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37,05■■■■□ 3,52
Gpc2Q8BKV1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,04■■■■□ 3,52
Gpc2Q8BKV1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36,65■■■■□ 3,46
Gpc2Q8BKV1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,46■■■■□ 3,43
Gpc2Q8BKV1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35,81■■■■□ 3,32
Gpc2Q8BKV1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,5■■■■□ 3,27
Gpc2Q8BKV1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,5■■■■□ 3,27
Gpc2Q8BKV1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35,45■■■■□ 3,27
Gpc2Q8BKV1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Gpc2Q8BKV1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Gpc2Q8BKV1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35,18■■■■□ 3,22
Gpc2Q8BKV1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Gpc2Q8BKV1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Gpc2Q8BKV1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Gpc2Q8BKV1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34,88■■■■□ 3,17
Gpc2Q8BKV1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Gpc2Q8BKV1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34,78■■■■□ 3,16
Gpc2Q8BKV1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Gpc2Q8BKV1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Gpc2Q8BKV1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,16■■■■□ 3,06
Gpc2Q8BKV1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34,15■■■■□ 3,06
Gpc2Q8BKV1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Gpc2Q8BKV1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,07■■■■□ 3,05
Gpc2Q8BKV1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Gpc2Q8BKV1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,85■■■■□ 3,01
Gpc2Q8BKV1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Gpc2Q8BKV1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Gpc2Q8BKV1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Gpc2Q8BKV1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33,7■■■□□ 2,99
Gpc2Q8BKV1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33,69■■■□□ 2,98
Gpc2Q8BKV1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33,57■■■□□ 2,96
Gpc2Q8BKV1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,55■■■□□ 2,96
Gpc2Q8BKV1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Gpc2Q8BKV1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33,34■■■□□ 2,93
Gpc2Q8BKV1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33,21■■■□□ 2,91
Gpc2Q8BKV1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Gpc2Q8BKV1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33,13■■■□□ 2,89
Gpc2Q8BKV1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,88
Gpc2Q8BKV1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32,99■■■□□ 2,87
Gpc2Q8BKV1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32,91■■■□□ 2,86
Gpc2Q8BKV1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32,9■■■□□ 2,86
Gpc2Q8BKV1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32,87■■■□□ 2,85
Gpc2Q8BKV1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Gpc2Q8BKV1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,86■■■□□ 2,85
Gpc2Q8BKV1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Gpc2Q8BKV1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Gpc2Q8BKV1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32,77■■■□□ 2,84
Gpc2Q8BKV1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32,73■■■□□ 2,83
Gpc2Q8BKV1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Gpc2Q8BKV1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Gpc2Q8BKV1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Gpc2Q8BKV1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32,64■■■□□ 2,82
Gpc2Q8BKV1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Gpc2Q8BKV1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Gpc2Q8BKV1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32,43■■■□□ 2,78
Gpc2Q8BKV1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32,43■■■□□ 2,78
Gpc2Q8BKV1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32,4■■■□□ 2,78
Gpc2Q8BKV1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32,25■■■□□ 2,75
Gpc2Q8BKV1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,75
Gpc2Q8BKV1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Gpc2Q8BKV1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,15■■■□□ 2,74
Gpc2Q8BKV1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,15■■■□□ 2,74
Gpc2Q8BKV1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Gpc2Q8BKV1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Gpc2Q8BKV1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32,08■■■□□ 2,73
Gpc2Q8BKV1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Gpc2Q8BKV1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
Gpc2Q8BKV1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
Gpc2Q8BKV1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Gpc2Q8BKV1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,9■■■□□ 2,7
Gpc2Q8BKV1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,88■■■□□ 2,69
Gpc2Q8BKV1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,84■■■□□ 2,69
Gpc2Q8BKV1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31,81■■■□□ 2,68
Gpc2Q8BKV1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31,81■■■□□ 2,68
Gpc2Q8BKV1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Gpc2Q8BKV1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Gpc2Q8BKV1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31,64■■■□□ 2,66
Gpc2Q8BKV1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31,62■■■□□ 2,65
Gpc2Q8BKV1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Gpc2Q8BKV1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31,56■■■□□ 2,64
Gpc2Q8BKV1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Gpc2Q8BKV1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,53■■■□□ 2,64
Gpc2Q8BKV1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,52■■■□□ 2,64
Gpc2Q8BKV1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31,5■■■□□ 2,63
Gpc2Q8BKV1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,49■■■□□ 2,63
Gpc2Q8BKV1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Gpc2Q8BKV1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31,48■■■□□ 2,63
Gpc2Q8BKV1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Gpc2Q8BKV1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,37■■■□□ 2,61
Gpc2Q8BKV1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31,35■■■□□ 2,61
Gpc2Q8BKV1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Gpc2Q8BKV1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Gpc2Q8BKV1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31,3■■■□□ 2,6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,9 ms