Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE9

Igtp, Interferon gamma-induced GTPase, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IgtpQ9DCE9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
IgtpQ9DCE9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
IgtpQ9DCE9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
IgtpQ9DCE9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
IgtpQ9DCE9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
IgtpQ9DCE9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
IgtpQ9DCE9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
IgtpQ9DCE9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
IgtpQ9DCE9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
IgtpQ9DCE9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
IgtpQ9DCE9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
IgtpQ9DCE9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
IgtpQ9DCE9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
IgtpQ9DCE9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
IgtpQ9DCE9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
IgtpQ9DCE9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
IgtpQ9DCE9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
IgtpQ9DCE9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
IgtpQ9DCE9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
IgtpQ9DCE9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
IgtpQ9DCE9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
IgtpQ9DCE9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
IgtpQ9DCE9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
IgtpQ9DCE9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
IgtpQ9DCE9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
IgtpQ9DCE9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
IgtpQ9DCE9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
IgtpQ9DCE9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
IgtpQ9DCE9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
IgtpQ9DCE9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
IgtpQ9DCE9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
IgtpQ9DCE9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
IgtpQ9DCE9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
IgtpQ9DCE9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
IgtpQ9DCE9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
IgtpQ9DCE9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IgtpQ9DCE9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
IgtpQ9DCE9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IgtpQ9DCE9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
IgtpQ9DCE9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
IgtpQ9DCE9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
IgtpQ9DCE9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IgtpQ9DCE9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IgtpQ9DCE9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IgtpQ9DCE9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IgtpQ9DCE9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IgtpQ9DCE9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IgtpQ9DCE9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IgtpQ9DCE9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
IgtpQ9DCE9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
IgtpQ9DCE9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IgtpQ9DCE9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IgtpQ9DCE9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IgtpQ9DCE9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IgtpQ9DCE9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IgtpQ9DCE9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IgtpQ9DCE9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IgtpQ9DCE9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IgtpQ9DCE9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IgtpQ9DCE9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
IgtpQ9DCE9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IgtpQ9DCE9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IgtpQ9DCE9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IgtpQ9DCE9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IgtpQ9DCE9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IgtpQ9DCE9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IgtpQ9DCE9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
IgtpQ9DCE9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IgtpQ9DCE9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IgtpQ9DCE9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IgtpQ9DCE9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IgtpQ9DCE9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IgtpQ9DCE9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
IgtpQ9DCE9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IgtpQ9DCE9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IgtpQ9DCE9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IgtpQ9DCE9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IgtpQ9DCE9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IgtpQ9DCE9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IgtpQ9DCE9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IgtpQ9DCE9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IgtpQ9DCE9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IgtpQ9DCE9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IgtpQ9DCE9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IgtpQ9DCE9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IgtpQ9DCE9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
IgtpQ9DCE9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IgtpQ9DCE9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IgtpQ9DCE9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IgtpQ9DCE9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IgtpQ9DCE9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IgtpQ9DCE9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IgtpQ9DCE9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IgtpQ9DCE9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IgtpQ9DCE9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IgtpQ9DCE9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IgtpQ9DCE9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IgtpQ9DCE9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IgtpQ9DCE9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IgtpQ9DCE9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.9 ms