Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,51■■■■□ 3,6
Cldn19Q9ET38 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,12
Cldn19Q9ET38 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Cldn19Q9ET38 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Cldn19Q9ET38 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Cldn19Q9ET38 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,12■■■□□ 2,89
Cldn19Q9ET38 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,09■■■□□ 2,89
Cldn19Q9ET38 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,48■■■□□ 2,79
Cldn19Q9ET38 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,36■■■□□ 2,77
Cldn19Q9ET38 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Cldn19Q9ET38 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,71
Cldn19Q9ET38 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,76■■■□□ 2,68
Cldn19Q9ET38 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Cldn19Q9ET38 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,52■■■□□ 2,64
Cldn19Q9ET38 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Cldn19Q9ET38 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,34■■■□□ 2,61
Cldn19Q9ET38 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Cldn19Q9ET38 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Cldn19Q9ET38 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Cldn19Q9ET38 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Cldn19Q9ET38 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Cldn19Q9ET38 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Cldn19Q9ET38 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Cldn19Q9ET38 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Cldn19Q9ET38 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Cldn19Q9ET38 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,71■■■□□ 2,51
Cldn19Q9ET38 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Cldn19Q9ET38 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Cldn19Q9ET38 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Cldn19Q9ET38 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Cldn19Q9ET38 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,48■■■□□ 2,47
Cldn19Q9ET38 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,43■■■□□ 2,46
Cldn19Q9ET38 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,3■■■□□ 2,44
Cldn19Q9ET38 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Cldn19Q9ET38 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Cldn19Q9ET38 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Cldn19Q9ET38 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Cldn19Q9ET38 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Cldn19Q9ET38 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,37
Cldn19Q9ET38 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Cldn19Q9ET38 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Cldn19Q9ET38 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Cldn19Q9ET38 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Cldn19Q9ET38 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Cldn19Q9ET38 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Cldn19Q9ET38 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Cldn19Q9ET38 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,5■■■□□ 2,31
Cldn19Q9ET38 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Cldn19Q9ET38 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Cldn19Q9ET38 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Cldn19Q9ET38 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Cldn19Q9ET38 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Cldn19Q9ET38 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Cldn19Q9ET38 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,29■■■□□ 2,28
Cldn19Q9ET38 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Cldn19Q9ET38 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Cldn19Q9ET38 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Cldn19Q9ET38 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Cldn19Q9ET38 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,08■■■□□ 2,25
Cldn19Q9ET38 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2,23
Cldn19Q9ET38 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Cldn19Q9ET38 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Cldn19Q9ET38 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Cldn19Q9ET38 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Cldn19Q9ET38 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Cldn19Q9ET38 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Cldn19Q9ET38 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Cldn19Q9ET38 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Cldn19Q9ET38 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,82■■■□□ 2,2
Cldn19Q9ET38 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Cldn19Q9ET38 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Cldn19Q9ET38 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,75■■■□□ 2,19
Cldn19Q9ET38 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Cldn19Q9ET38 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Cldn19Q9ET38 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Cldn19Q9ET38 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Cldn19Q9ET38 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Cldn19Q9ET38 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Cldn19Q9ET38 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Cldn19Q9ET38 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Cldn19Q9ET38 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Cldn19Q9ET38 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Cldn19Q9ET38 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Cldn19Q9ET38 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Cldn19Q9ET38 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Cldn19Q9ET38 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,3■■■□□ 2,12
Cldn19Q9ET38 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Cldn19Q9ET38 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Cldn19Q9ET38 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Cldn19Q9ET38 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Cldn19Q9ET38 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Cldn19Q9ET38 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Cldn19Q9ET38 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Cldn19Q9ET38 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Cldn19Q9ET38 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Cldn19Q9ET38 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Cldn19Q9ET38 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Cldn19Q9ET38 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Cldn19Q9ET38 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28,02■■■□□ 2,08
Cldn19Q9ET38 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
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