Protein–RNA interactions for Protein: P56198

Cidec, Cell death activator CIDE-3, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CidecP56198 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39,51■■■■□ 3,92
CidecP56198 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,43
CidecP56198 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
CidecP56198 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34,67■■■■□ 3,14
CidecP56198 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,14
CidecP56198 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34,21■■■■□ 3,07
CidecP56198 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
CidecP56198 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33,96■■■■□ 3,03
CidecP56198 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
CidecP56198 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,53■■■□□ 2,96
CidecP56198 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
CidecP56198 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
CidecP56198 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33,01■■■□□ 2,87
CidecP56198 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
CidecP56198 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
CidecP56198 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,4■■■□□ 2,78
CidecP56198 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
CidecP56198 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
CidecP56198 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
CidecP56198 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
CidecP56198 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31,99■■■□□ 2,71
CidecP56198 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,96■■■□□ 2,71
CidecP56198 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
CidecP56198 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
CidecP56198 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
CidecP56198 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
CidecP56198 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,78■■■□□ 2,68
CidecP56198 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,72■■■□□ 2,67
CidecP56198 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31,63■■■□□ 2,65
CidecP56198 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
CidecP56198 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,4■■■□□ 2,62
CidecP56198 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
CidecP56198 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
CidecP56198 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
CidecP56198 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,16■■■□□ 2,58
CidecP56198 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31,15■■■□□ 2,58
CidecP56198 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31,1■■■□□ 2,57
CidecP56198 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
CidecP56198 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
CidecP56198 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
CidecP56198 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
CidecP56198 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
CidecP56198 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
CidecP56198 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,59■■■□□ 2,49
CidecP56198 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,57■■■□□ 2,48
CidecP56198 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
CidecP56198 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30,49■■■□□ 2,47
CidecP56198 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
CidecP56198 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30,43■■■□□ 2,46
CidecP56198 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
CidecP56198 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,33■■■□□ 2,45
CidecP56198 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
CidecP56198 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30,24■■■□□ 2,43
CidecP56198 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
CidecP56198 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,14■■■□□ 2,42
CidecP56198 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
CidecP56198 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30,09■■■□□ 2,41
CidecP56198 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
CidecP56198 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,07■■■□□ 2,4
CidecP56198 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
CidecP56198 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
CidecP56198 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
CidecP56198 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
CidecP56198 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,82■■■□□ 2,36
CidecP56198 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
CidecP56198 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
CidecP56198 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
CidecP56198 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29,77■■■□□ 2,36
CidecP56198 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
CidecP56198 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29,74■■■□□ 2,35
CidecP56198 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,74■■■□□ 2,35
CidecP56198 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
CidecP56198 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
CidecP56198 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29,65■■■□□ 2,34
CidecP56198 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
CidecP56198 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,62■■■□□ 2,33
CidecP56198 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
CidecP56198 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
CidecP56198 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
CidecP56198 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
CidecP56198 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29,48■■■□□ 2,31
CidecP56198 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,47■■■□□ 2,31
CidecP56198 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
CidecP56198 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
CidecP56198 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29,38■■■□□ 2,29
CidecP56198 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
CidecP56198 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
CidecP56198 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29,29■■■□□ 2,28
CidecP56198 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
CidecP56198 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,26■■■□□ 2,27
CidecP56198 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
CidecP56198 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,26
CidecP56198 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
CidecP56198 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
CidecP56198 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29,1■■■□□ 2,25
CidecP56198 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
CidecP56198 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
CidecP56198 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
CidecP56198 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,97■■■□□ 2,23
CidecP56198 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,96■■■□□ 2,23
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