Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z184

Padi3, Protein-arginine deiminase type-3, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi3Q9Z184 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
Padi3Q9Z184 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Padi3Q9Z184 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Padi3Q9Z184 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Padi3Q9Z184 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Padi3Q9Z184 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Padi3Q9Z184 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Padi3Q9Z184 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Padi3Q9Z184 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Padi3Q9Z184 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Padi3Q9Z184 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Padi3Q9Z184 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Padi3Q9Z184 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Padi3Q9Z184 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Padi3Q9Z184 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Padi3Q9Z184 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Padi3Q9Z184 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Padi3Q9Z184 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Padi3Q9Z184 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Padi3Q9Z184 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Padi3Q9Z184 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Padi3Q9Z184 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Padi3Q9Z184 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Padi3Q9Z184 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Padi3Q9Z184 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Padi3Q9Z184 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Padi3Q9Z184 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Padi3Q9Z184 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Padi3Q9Z184 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Padi3Q9Z184 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Padi3Q9Z184 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Padi3Q9Z184 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Padi3Q9Z184 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Padi3Q9Z184 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Padi3Q9Z184 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Padi3Q9Z184 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Padi3Q9Z184 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Padi3Q9Z184 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Padi3Q9Z184 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Padi3Q9Z184 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Padi3Q9Z184 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Padi3Q9Z184 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Padi3Q9Z184 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Padi3Q9Z184 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Padi3Q9Z184 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Padi3Q9Z184 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Padi3Q9Z184 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Padi3Q9Z184 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Padi3Q9Z184 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Padi3Q9Z184 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Padi3Q9Z184 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Padi3Q9Z184 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Padi3Q9Z184 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Padi3Q9Z184 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Padi3Q9Z184 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Padi3Q9Z184 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Padi3Q9Z184 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Padi3Q9Z184 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Padi3Q9Z184 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Padi3Q9Z184 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Padi3Q9Z184 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Padi3Q9Z184 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Padi3Q9Z184 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Padi3Q9Z184 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Padi3Q9Z184 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Padi3Q9Z184 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Padi3Q9Z184 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Padi3Q9Z184 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Padi3Q9Z184 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Padi3Q9Z184 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Padi3Q9Z184 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Padi3Q9Z184 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Padi3Q9Z184 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Padi3Q9Z184 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Padi3Q9Z184 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Padi3Q9Z184 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Padi3Q9Z184 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Padi3Q9Z184 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Padi3Q9Z184 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Padi3Q9Z184 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Padi3Q9Z184 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Padi3Q9Z184 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Padi3Q9Z184 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Padi3Q9Z184 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Padi3Q9Z184 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Padi3Q9Z184 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Padi3Q9Z184 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Padi3Q9Z184 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Padi3Q9Z184 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Padi3Q9Z184 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Padi3Q9Z184 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Padi3Q9Z184 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Padi3Q9Z184 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Padi3Q9Z184 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Padi3Q9Z184 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Padi3Q9Z184 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Padi3Q9Z184 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Padi3Q9Z184 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Padi3Q9Z184 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Padi3Q9Z184 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 235.1 ms