Protein–RNA interactions for Protein: O70326

Grem1, Gremlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grem1O70326 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41,18■■■■■ 4,18
Grem1O70326 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38,12■■■■□ 3,69
Grem1O70326 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,53■■■■□ 3,6
Grem1O70326 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35,87■■■■□ 3,33
Grem1O70326 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35,78■■■■□ 3,32
Grem1O70326 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35,13■■■■□ 3,21
Grem1O70326 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Grem1O70326 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Grem1O70326 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,77■■■■□ 3,16
Grem1O70326 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Grem1O70326 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Grem1O70326 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34,33■■■■□ 3,09
Grem1O70326 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Grem1O70326 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,77■■■■□ 3
Grem1O70326 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Grem1O70326 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33,34■■■□□ 2,93
Grem1O70326 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33,15■■■□□ 2,9
Grem1O70326 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33,13■■■□□ 2,89
Grem1O70326 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Grem1O70326 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33,02■■■□□ 2,88
Grem1O70326 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Grem1O70326 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,94■■■□□ 2,86
Grem1O70326 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Grem1O70326 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Grem1O70326 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Grem1O70326 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Grem1O70326 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Grem1O70326 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Grem1O70326 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32,57■■■□□ 2,8
Grem1O70326 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Grem1O70326 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Grem1O70326 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32,47■■■□□ 2,79
Grem1O70326 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32,4■■■□□ 2,78
Grem1O70326 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Grem1O70326 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,76
Grem1O70326 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,05■■■□□ 2,72
Grem1O70326 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Grem1O70326 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,88■■■□□ 2,69
Grem1O70326 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,71■■■□□ 2,67
Grem1O70326 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31,66■■■□□ 2,66
Grem1O70326 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Grem1O70326 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Grem1O70326 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,52■■■□□ 2,64
Grem1O70326 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31,51■■■□□ 2,63
Grem1O70326 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,46■■■□□ 2,63
Grem1O70326 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Grem1O70326 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Grem1O70326 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31,26■■■□□ 2,59
Grem1O70326 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Grem1O70326 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Grem1O70326 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31,16■■■□□ 2,58
Grem1O70326 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Grem1O70326 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Grem1O70326 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,95■■■□□ 2,55
Grem1O70326 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Grem1O70326 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Grem1O70326 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,91■■■□□ 2,54
Grem1O70326 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30,91■■■□□ 2,54
Grem1O70326 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Grem1O70326 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30,82■■■□□ 2,52
Grem1O70326 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30,7■■■□□ 2,51
Grem1O70326 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Grem1O70326 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Grem1O70326 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Grem1O70326 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30,64■■■□□ 2,5
Grem1O70326 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Grem1O70326 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,62■■■□□ 2,49
Grem1O70326 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30,58■■■□□ 2,49
Grem1O70326 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30,55■■■□□ 2,48
Grem1O70326 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Grem1O70326 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Grem1O70326 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Grem1O70326 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30,41■■■□□ 2,46
Grem1O70326 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Grem1O70326 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Grem1O70326 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,35■■■□□ 2,45
Grem1O70326 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Grem1O70326 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Grem1O70326 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Grem1O70326 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Grem1O70326 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Grem1O70326 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Grem1O70326 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30,26■■■□□ 2,43
Grem1O70326 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Grem1O70326 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Grem1O70326 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Grem1O70326 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Grem1O70326 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Grem1O70326 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30,14■■■□□ 2,42
Grem1O70326 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Grem1O70326 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Grem1O70326 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,09■■■□□ 2,41
Grem1O70326 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Grem1O70326 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Grem1O70326 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Grem1O70326 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Grem1O70326 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,94■■■□□ 2,38
Grem1O70326 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Grem1O70326 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Grem1O70326 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,9■■■□□ 2,38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34,5 ms