Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG2

Plxna4, Plexin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna4Q80UG2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41,68■■■■■ 4,26
Plxna4Q80UG2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38,85■■■■□ 3,81
Plxna4Q80UG2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,93■■■■□ 3,66
Plxna4Q80UG2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36,41■■■■□ 3,42
Plxna4Q80UG2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36,14■■■■□ 3,38
Plxna4Q80UG2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35,52■■■■□ 3,28
Plxna4Q80UG2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,24
Plxna4Q80UG2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Plxna4Q80UG2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
Plxna4Q80UG2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Plxna4Q80UG2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34,69■■■■□ 3,14
Plxna4Q80UG2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Plxna4Q80UG2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34,01■■■■□ 3,04
Plxna4Q80UG2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Plxna4Q80UG2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33,64■■■□□ 2,98
Plxna4Q80UG2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Plxna4Q80UG2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,52■■■□□ 2,96
Plxna4Q80UG2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Plxna4Q80UG2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Plxna4Q80UG2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Plxna4Q80UG2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33,22■■■□□ 2,91
Plxna4Q80UG2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Plxna4Q80UG2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,04■■■□□ 2,88
Plxna4Q80UG2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33■■■□□ 2,87
Plxna4Q80UG2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32,97■■■□□ 2,87
Plxna4Q80UG2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Plxna4Q80UG2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,79■■■□□ 2,84
Plxna4Q80UG2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Plxna4Q80UG2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,83
Plxna4Q80UG2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Plxna4Q80UG2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Plxna4Q80UG2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Plxna4Q80UG2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,32■■■□□ 2,76
Plxna4Q80UG2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32,26■■■□□ 2,75
Plxna4Q80UG2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Plxna4Q80UG2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31,97■■■□□ 2,71
Plxna4Q80UG2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,93■■■□□ 2,7
Plxna4Q80UG2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Plxna4Q80UG2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31,84■■■□□ 2,69
Plxna4Q80UG2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
Plxna4Q80UG2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Plxna4Q80UG2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Plxna4Q80UG2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,61■■■□□ 2,65
Plxna4Q80UG2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,61■■■□□ 2,65
Plxna4Q80UG2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31,59■■■□□ 2,65
Plxna4Q80UG2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31,57■■■□□ 2,64
Plxna4Q80UG2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,48■■■□□ 2,63
Plxna4Q80UG2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Plxna4Q80UG2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Plxna4Q80UG2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31,21■■■□□ 2,59
Plxna4Q80UG2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31,21■■■□□ 2,59
Plxna4Q80UG2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31,16■■■□□ 2,58
Plxna4Q80UG2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,11■■■□□ 2,57
Plxna4Q80UG2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31,07■■■□□ 2,56
Plxna4Q80UG2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Plxna4Q80UG2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31,01■■■□□ 2,55
Plxna4Q80UG2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2,55
Plxna4Q80UG2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Plxna4Q80UG2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Plxna4Q80UG2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30,97■■■□□ 2,55
Plxna4Q80UG2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Plxna4Q80UG2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30,92■■■□□ 2,54
Plxna4Q80UG2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,89■■■□□ 2,54
Plxna4Q80UG2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,88■■■□□ 2,53
Plxna4Q80UG2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Plxna4Q80UG2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Plxna4Q80UG2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Plxna4Q80UG2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,68■■■□□ 2,5
Plxna4Q80UG2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30,67■■■□□ 2,5
Plxna4Q80UG2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Plxna4Q80UG2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Plxna4Q80UG2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Plxna4Q80UG2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30,59■■■□□ 2,49
Plxna4Q80UG2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Plxna4Q80UG2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Plxna4Q80UG2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,48■■■□□ 2,47
Plxna4Q80UG2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Plxna4Q80UG2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Plxna4Q80UG2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Plxna4Q80UG2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Plxna4Q80UG2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Plxna4Q80UG2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Plxna4Q80UG2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Plxna4Q80UG2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Plxna4Q80UG2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Plxna4Q80UG2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30,22■■■□□ 2,43
Plxna4Q80UG2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Plxna4Q80UG2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30,13■■■□□ 2,41
Plxna4Q80UG2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30,13■■■□□ 2,41
Plxna4Q80UG2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Plxna4Q80UG2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Plxna4Q80UG2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Plxna4Q80UG2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Plxna4Q80UG2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Plxna4Q80UG2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Plxna4Q80UG2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Plxna4Q80UG2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Plxna4Q80UG2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Plxna4Q80UG2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Plxna4Q80UG2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42,4 ms