Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Stx12Q9ER00 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,28■■■□□ 2,76
Stx12Q9ER00 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,25■■■□□ 2,75
Stx12Q9ER00 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Stx12Q9ER00 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,34■■■□□ 2,61
Stx12Q9ER00 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Stx12Q9ER00 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Stx12Q9ER00 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Stx12Q9ER00 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Stx12Q9ER00 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Stx12Q9ER00 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Stx12Q9ER00 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Stx12Q9ER00 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Stx12Q9ER00 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,48■■■□□ 2,31
Stx12Q9ER00 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Stx12Q9ER00 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Stx12Q9ER00 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Stx12Q9ER00 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Stx12Q9ER00 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,32■■■□□ 2,28
Stx12Q9ER00 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Stx12Q9ER00 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Stx12Q9ER00 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Stx12Q9ER00 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Stx12Q9ER00 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Stx12Q9ER00 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Stx12Q9ER00 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,79■■■□□ 2,2
Stx12Q9ER00 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Stx12Q9ER00 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Stx12Q9ER00 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Stx12Q9ER00 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,51■■■□□ 2,15
Stx12Q9ER00 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Stx12Q9ER00 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Stx12Q9ER00 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Stx12Q9ER00 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Stx12Q9ER00 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Stx12Q9ER00 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,33■■■□□ 2,13
Stx12Q9ER00 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Stx12Q9ER00 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Stx12Q9ER00 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Stx12Q9ER00 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Stx12Q9ER00 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Stx12Q9ER00 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Stx12Q9ER00 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,1■■■□□ 2,09
Stx12Q9ER00 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Stx12Q9ER00 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Stx12Q9ER00 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Stx12Q9ER00 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Stx12Q9ER00 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Stx12Q9ER00 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Stx12Q9ER00 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Stx12Q9ER00 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Stx12Q9ER00 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Stx12Q9ER00 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Stx12Q9ER00 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Stx12Q9ER00 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Stx12Q9ER00 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Stx12Q9ER00 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Stx12Q9ER00 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Stx12Q9ER00 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Stx12Q9ER00 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,44■■□□□ 1,98
Stx12Q9ER00 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Stx12Q9ER00 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,38■■□□□ 1,97
Stx12Q9ER00 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Stx12Q9ER00 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Stx12Q9ER00 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Stx12Q9ER00 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Stx12Q9ER00 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Stx12Q9ER00 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Stx12Q9ER00 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Stx12Q9ER00 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Stx12Q9ER00 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,16■■□□□ 1,94
Stx12Q9ER00 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Stx12Q9ER00 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Stx12Q9ER00 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Stx12Q9ER00 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Stx12Q9ER00 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Stx12Q9ER00 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Stx12Q9ER00 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Stx12Q9ER00 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,94■■□□□ 1,9
Stx12Q9ER00 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Stx12Q9ER00 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Stx12Q9ER00 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Stx12Q9ER00 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Stx12Q9ER00 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Stx12Q9ER00 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Stx12Q9ER00 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Stx12Q9ER00 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Stx12Q9ER00 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Stx12Q9ER00 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,7■■□□□ 1,86
Stx12Q9ER00 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,7■■□□□ 1,86
Stx12Q9ER00 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Stx12Q9ER00 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Stx12Q9ER00 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Stx12Q9ER00 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Stx12Q9ER00 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Stx12Q9ER00 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Stx12Q9ER00 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Stx12Q9ER00 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Stx12Q9ER00 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Stx12Q9ER00 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,5 ms